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德尔塔变异毒株已传播至92个国家,核酸检测能否跟上它的脚步?

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健身爱教练 2021-06-23 11:19
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6月21日,广东东莞开展全市全员核酸检测 图片来源:视觉中国

变异的新冠病毒Delta毒株,正考验着中国对新冠病毒的防御能力。

6月19日,深圳市通报上一日两名新增本土确诊病例,所感染的病毒均为变异新冠病毒Delta毒株。而5月21日报告第一例本土感染的广州疫情,也是由该变异新冠病毒导致。

为应对Delta变异毒株,广东省多地已开展多轮大规模核酸筛查。深圳市副市长陶永欣6月19日在深圳市疫情防控新闻发布会上表示,深圳市涉及的重点区和重点行业已经开展多轮大规模核酸筛查。6月21日,广东省东莞市、寮步镇等地也启动了全市核酸检测。

这也被认为是中国与Delta变异毒株的第一次正面遭遇战,在有着超强传播力的Delta变异毒株面前,国内所依靠的核酸检测手段将如何应对?

超强传播力的Delta

Delta变异毒株是由新冠病毒B.1.617.2变异株进一步变异而成的,最早发现于印度。今年5月,世界卫生组织(WHO)给这种变异病毒起名为Delta(德尔塔)变异株。

与其他毒株相比,Delta变异毒株最让人警惕之处在于其超强的传播力。中国疾控中心研究员冯子健6月11日在国务院联防联控机制新闻发布会上表示,Delta变异毒株的传播能力是目前已经确定的几个新冠病毒值得关注的变异株里传播能力最强的,比过去的老的毒株传播能力提高了100%,也比英国首先发现的变异毒株的传播能力提高了40%多。

超强的传播力也让Delta变异毒株迅速在全球蔓延。

英国英格兰公共卫生署当地时间6月18日发布报告表示,该国自6月11日以来,感染“德尔塔(Delta)毒株”的病例增加了33630例,根据最新测序和基因分型数据显示,过去一周,英国目前有99%的确诊病例感染了Delta变异毒株。俄罗斯莫斯科市长索比亚宁表示,莫斯科89.3%的新冠肺炎患者体内都发现了Delta变异毒株。

WHO首席科学家斯瓦米纳坦6月18日则表示,最初在印度发现的新冠变种病毒Delta正成为全球主要流行的变种病毒株。根据世卫官员16日发布的数据,Delta变种已传播至超过80个国家。

万孚生物方面对界面新闻介绍称,目前全球范围内发现的变异株有多种,但是引起科学家们注意的主要是英国株(Alpha)、南非株(Beta)、巴西株(Gamma)、印度株(Delta)等变异株,上述变异株在传染性以及免疫逃逸方面都有所增强,对疫情防控及疫苗接种工作都带来了新的挑战。

而除了急需研究各种新冠疫苗对变异毒株的保护效力,作为疫情防控的另一款有力武器,现有的核酸检测手段又能否准确的检测出Delta变异毒株?

核酸检测迎战Delta变异毒株

据华大基因向界面新闻介绍,在实践中,核酸检测准确性会受到病毒特征、检测产品或技术本身、采样过程、样本储存、运输及检测能力等因素的影响。

而核酸检测是对新冠病毒特征RNA序列进行RT-PCR扩增反应,体外定性检测受检者样本中的新冠病毒核酸。由于核酸是病毒的遗传物质,理论上对新冠病毒的特征序列进行核酸检测就可以确定是否为新冠病毒感染。而不同生产商在设计核酸检测试剂盒时使用的引物探针并不相同,对新冠病毒突变株的检测能力不能一概而论,需要具体分析。

宾夕法尼亚大学医学院病理及实验医药系副教授张洪涛用“拉链”来比喻新冠病毒核酸检测。其介绍到,DNA有两条互补的拉链,检测病毒的PCR反应,也是按照两条链的互补性进行的。

“PCR就是把互补的两条拉链从其尾巴的位置拉起来。变异新冠病毒可以理解为拉链上的某个齿坏了,但如果坏在中间,也许还拉得过去,但如果拉链的尾巴位置坏了,PCR就拉不过去了。”张洪涛告诉界面新闻记者。

张洪涛表示,一般检测试剂盒里也会同时有两条、甚至三条拉链,虽然病毒突变频繁发生,但是几条拉链同时都坏掉的概率非常小。因此如果是“中间的齿坏了”原有的核酸检测试剂一般还能检测出病毒,但可能会只有在变异新冠病毒载量更高的时候才能测得出,如果疫情变严重了,就要考虑更新检测试剂,以方便在感染早期就及时发现感染者。因此他认为,可以先用原有的新冠检测试剂进行大规模测量,再针对性地对阳性患者来使用特定试剂以精确筛查。

不过,据万孚生物介绍,国内此前已上市的大多数新冠核酸检测试剂不能够区分新冠普通株以及变异株,这给相关流调工作带来一定的困难。这也就要求新冠核酸检测厂家要具备快速响应能力以及快速研发能力,以便应对未来新发现的变异株的检测,新开发的试剂如果需要快速上市,尽早的投入到疫情防控中,还需要相关政府部门的政策支持。

在这样的情况下,就要先对新冠病毒进行基因测序,知道拉链坏在哪,才可以针对拉链的变异进行的调整。“测序完成之后,制定出相应的检测试剂是十分容易的。”张洪涛告诉界面新闻记者。

目前,英国和国内都已经研发出了针对Delta变异毒株的新冠检测试剂。6月9日,广州市科学技术局党组成员、副局长孙翔在广州市政府新闻发布会上透露,达安基因、万孚生物都开发出了新的核酸检测试剂。

复星医药旗下复星诊断对界面新闻介绍,针对变异毒株的“检测”和“鉴别”概念不一样,“检测”是检测新冠病毒阳性与否,而“鉴别”具体是哪种变异毒株则需要采用另外的试剂或方法。目前变异毒株种类鉴别国内多用测序法,也可以采用专门的变异株鉴别试剂。

万孚生物对界面新闻表示,针对突变毒株的新检测试剂不需要进行太大的改动,只需要开发针对的变异株的特异性的引物及探针,对反应体系进行适当调整,并进行临床验证即可。

不过复星诊断也表示,其自主研发的新冠核酸检测试剂同时检测ORF1ab、N和E基因等3靶标序列,各靶标结果相互验证,对低病毒载量样本及发生点突变的病毒株,不易发生漏检,根据其对引物探针与国际上最新变异株(包含但不限于B.1.1.7、B.1.351、P.1、B.1.617变异株)携带的突变位点的核对,结果证实不会出现脱靶和漏检情况,可保证该试剂针对变异株检测和常规新冠病毒检测的准确性和灵敏性一致。

而在实验室检验流程上,金域医学和多家检测企业都告诉界面新闻记者,变异新冠病毒的实验室检验流程上同此前的新冠病毒毒株一致,无需调整。

虽然检测试剂的开发并不困难,但如何在实践中保障大规模的检测结果对各个省市来说仍然是个考验。“既要同时对大规模人群进行检测,又要防止人群互相感染,还要防止新冠疫苗污染核酸检测的结果。”张洪涛提到了落实大规模核酸检测的难处。

华大基因也向界面新闻表示,核酸检测的采样过程、样本的储存、运输的安全性都是大规模进行核酸检测所需面临的挑战。

此外,新研发的针对Delta变异毒株的试剂盒的产量提升也需要时间,而在于Delta变异毒株的交手中,依然需要足量的新试剂来保障大规模检测的准确性,这在短期内也可能会成为一个挑战。

来源:界面新闻 编辑 吕瑞天

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