新冠病毒变异株频频出现，对疫情防控以及疫苗和药物疗效构成了新的威胁。一项发表于《医学病毒学杂志》(Journal of Medical Virology)的研究中，来自意大利博洛尼亚大学的科学家们又检测到了一种新型变异毒株。
据悉，该毒株在最近几周内一直在北美和欧洲传播，许多新病例集中在墨西哥。
研究团队分析了截至2021年4月27日存放在GISAID公共数据库中的100多万条SARS-CoV-2基因组序列，并确定了一个位于SARS-CoV-2刺突蛋白上的新的T478K突变。该突变在结构上位于与人类受体ACE2的相互作用区域，在11,435个不同的病例中检测到。
该突变在结构上位于与人类受体ACE2的相互作用区域——冠状病毒附着在这个受体上感染细胞，从而更有效地实现传播感染。它还可以改变与免疫系统抗体的相互作用，从而阻碍药物的疗效。研究人员们发现，自2021年1月以来，T478K已经出现并出现频率上升，主要是在墨西哥和美国，但也可以在几个欧洲国家检测到它。
于2021年4月27日从GISAID数据库下载了所有公开获得的SARS-CoV-2基因组序列。结果获得了1,180571份样本，并标注了特征，如收集日期、来源地区、年龄和感染患者的性别。只有从人类宿主收集的病毒被保存起来进行进一步处理、筛检。
总的来说，截至2021年4月27日，他们在11,435名不同患者中检测到了T478K蛋白突变，是一个月前(2021年3月26日)观察到的数字(4214)的两倍多。约97%的突变（20205个样本）与穿山甲谱系的病毒变种B.1.1.519相关，其余的T478K突变事件在其他非来自B.1.1.519的谱系中分布较少，这支持了该突变在不同事件中不止一次出现的假设。
在B.1.214.3报告的85个样本中，有68个(80%)存在T478K蛋白突变；然而，这一谱系的病例总数很低，还没有使它成为一个值得关注的变体。
“这个变异株在北美的人群中日益蔓延，特别是在墨西哥。到目前为止，该变异毒株覆盖了这一地区现有病毒的50%以上，传播速度之快令人想起了最先在英国报告的变异毒株。”研究通讯作者、药学和生物技术系教授Federico Giorgi表示。
进一步的分析甚至表明，“墨西哥变异毒株”可能具有一种潜在的遗传途径，可以逃避免疫识别。据现有数据，T478K似乎在性别和年龄范围内均匀分布。在墨西哥，它占所有测序病毒的52.8%，占所有测序的美国样本的2.7%。在欧洲，研究人员表示T478K已经在德国、瑞士和瑞典“微弱地传播”。
译/前瞻经济学人APP资讯组
参考资料：https://www.eurekalert.org/pub_releases/2021-06/udb-va060421.php
https://www.indiatvnews.com/news/world/mexican-covid-mutation-increases-at-alarming-rate-researchers-coronavirus-pandemic-updates-news-709700
论文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.27062