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电报|新冠病毒全套蛋白质编码基因图谱完成

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SJ研究 2021-05-12 16:50
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近日,美国麻省理工的研究团队在《自然·通讯》(Nature Communications)发布了他们的研究成果。通过比较44种Sarbecovirus基因组,新冠病毒基因含量和病毒突变影响,研究人员已经绘制出新冠病毒迄今为止最准确,最完整的基因注释图谱

早在2020年1月11日,中国研究人员在网上发布了新冠病毒的第一个基因组草图。由于与其他冠状病毒有很多相似之处,因此很快确定了许多病毒基因。但是,蛋白质编码基因的完整补充仍未解决。

在本次的研究中,该团队使用比较基因组学来阐明SARS-CoV-2基因组。SARS-CoV-2病毒属于一种称为Sarbecovirus的病毒亚类,其中大多数感染蝙蝠。研究人员对新冠病毒,SARS病毒和42株蝙蝠sarbecovirus病毒进行了分析。除此之外,研究团队还将人类的基因序列与其他哺乳动物的基因序列进行了比较。使用这些技术,研究人员确认了新冠病毒基因组中的六个蛋白质编码基因,以及在所有冠状病毒中已经确立的五个蛋白质编码基因。

除了注释工作外,研究人员还分析了自首次发现新冠病毒以来出现的1800多个突变。对于每个基因,他们比较了该特定基因过去进化的速度与自当前大流行开始以来其进化的速度。他们发现,在大多数情况下,在当前的大流行之前,长期快速进化的基因仍将继续快速进化,而趋于缓慢进化的基因则保持了这种趋势。

研究人员还分析了所关注的变体中出现的突变,例如来自英格兰的B.1.1.7菌株,来自巴西的P.1菌株和来自南非的B.1.351菌株。在刺突蛋白中发现了许多使这些变体更危险的突变,它们有助于病毒更快地传播并避免免疫系统。

(资料来源:genengnews)

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