印度尼西亚海军负责人艾德麦拉尔 在当地时间4月25日举行的记者发布会上确认，印尼沉没的KRI Nanggala-402号潜艇已经在海底解体为3大块，所在海底深度为838米。新加坡搜救人员用深入海底探测的摄像机拍到了潜艇残骸画面。印尼军方负责人称，印尼搜救人员找到了失踪潜艇残骸，扫描发现潜艇在水下850米深的位置，远远超过其生存极限。
当地时间4月21日3时左右，印尼海军潜艇“南伽拉”号在巴厘岛附近海域执行训练任务时失联，当时潜艇上共载有53人。潜艇失联后，印尼政府投入多艘舰船、多架飞机和数百名搜救人员进行搜救，新加坡、美国、澳大利亚、马来西亚等国也协助搜救。
4月22日，印尼空中搜救人员在潜艇失联地点附近海域发现了燃油泄漏的痕迹。
4月23日，印尼军方发言人里亚德表示，已找到失联潜艇可能所在的区域，检测到了疑似潜艇的物体，将缩小搜救范围。
4月24日，印尼军方将失联潜艇的状态由“失联”改为“沉没”。军方表示，搜救人员已找到了潜艇的残骸，包括潜艇内部的部件和物品。马戈诺称，探测设备检测到失事潜艇在水下850米深的位置。潜艇没有爆炸，而是可能破裂严重，在水压作用下，潜艇多个部件分离。
当天，哈迪表示，失事潜艇的供氧只能持续72个小时，到当天凌晨氧气应该已经耗尽，虽然还未发现尸体，但船上船员应该凶多吉少。
4月25日，哈迪宣布，失事潜艇被分成了3个部分，船上53名船员全部遇难。
这次失事的潜艇为德国制造的209型常规动力潜艇，在1981年时就已经交付给了印尼海军服役。从服役年限来说，这已经是一艘很老旧的潜艇了，但这对于经济欠发达的国家来说，也是一个无奈的选择。
德国产209型潜艇，划设有1100、1200、1300、1400以及1500三个子型号，印尼这次出事的是1300型，最大潜航深度为250米。从潜艇已断成3截这一描述来分析，这次失事的潜艇可能因为某种原因突破了250米的最大潜深，导致艇体遇到了超出其设计指标的海水压强，最终被压碎。