科研进展

1、肠道微生物指纹：揭示个体肠道微生物的遗传物质特异性及长期稳定性

Cell，荷兰格罗宁根大学医学中心研究人员利用非靶向代谢组技术在血浆样品中测定了1000多种代谢物的含量，发现近15%的代谢物可能由肠道微生物产生。

进一步将肠道微生物变化与血浆代谢物相关联，发现一些个体肠道中细菌菌株的改变与血浆代谢物变化相关。例如，个体肠道中益生菌Faecalibacterium prausnitzii菌株的变化与其血浆中多种心血管病相关的代谢物浓度变化相关。

除菌株层面变化外，肠道微生物的含量，特定遗传组成等变化也与血浆代谢物广泛相关，特别是与尿毒素及硫胺素等与心血管病及慢性肾病相关的代谢物。值得注意的是，22.6%的菌群-代谢物关联是在Blautia wexlerae的遗传组成变异中发现，而这些变异区域具有编码膜结构、氨基酸酶、尿酶和蛋白结合等功能。进一步通过双向中介分析揭示了肠道微生物通过其代谢物影响宿主血压、血糖及血脂等心血管病指标，极大程度上丰富了我们对于肠道微生物代谢物在人类健康和疾病中的分子作用机制的认识。

该研究还系统性地测定了肠道微生物所携带的抗生素抗性及毒性物质合成基因含量，发现随着时间的推移肠道微生物所携带的抗生素抗性及基因含量有显著的富集，且该富集可能与肉蛋奶等摄入量有关。

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00352-4?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867421003524%3Fshowall%3Dtrue

2、Nature子刊：开发全新测序技术有望极大拓展小RNA研究领域

Nature Cell Biology，加利福尼亚大学、内华达大学和北京师范大学等联合团队开发了一种全新RNA测序技术PANDORA-Seq，该技术使用一系列酶的组合处理，去除RNA上的一些影响测序技术的关键修饰，再进行对RNA的测序分析。

和传统RNA-Seq相比，PANDORA-Seq揭示了与其完全不同的小RNA全景图。先前，哺乳动物被研究最充分的小RNA是microRNAs和piRNA，而PANDORA-Seq则找到了大量转运RNA衍生的小RNA（tsRNAs）与核糖体RNA衍生的小RNA（rsRNAs），这些在过去都没有得到检测。在小鼠中，这些小RNA展现出了组织特异的表达模式。

此外，这些小RNA水平在体细胞诱导成为干细胞的过程中也会有所下降，表明它们在细胞分化中可能有着独特的功能。（学术经纬）

https://www.nature.com/articles/s41556-021-00652-7

3、饮食模式如何影响肠道菌群

Gut，研究人员纳入4个队列中的1425名受试者（包括IBD患者、IBS患者及健康人），分析173种饮食因素与肠道菌群的关联，发现无论是否存在肠道疾病（克罗恩病、溃疡性结肠炎、肠易激综合征），长期饮食模式与肠道菌群之间存在一致的关联。

研究人员鉴定出饮食因素与微生物集群之间的38个关联，以及61种食物及营养与61个菌种及249种代谢通路之间的关联；在所有人群中，摄入加工食物及动物性食物与厚壁菌门、瘤胃球菌属物种、布劳特氏菌属、内毒素合成通路的丰度升高相关；摄入植物性食物及鱼类与短链脂肪酸产生菌、多糖等营养代谢通路的富集相关，并与致病共生菌的减少相关。

该研究有助于进一步揭示饮食-菌群-肠道炎症反应之间的关系，对今后设计靶向肠道菌群以缓解肠道炎症的饮食干预有重要参考价值。

https://gut.bmj.com/content/early/2021/03/08/gutjnl-2020-322670.info