1. 主谓残缺
论文写作中，必须在读者、作者间有“共同语言，才能保证论文的可读性。这一“共同语言”就是中文语法规则。医学论文中常见的语法错误亦很多见，如“使用该装置试生产的药品又快又好”。这里主语项是“试生产的药品”，指的是一种物品，它和谓语项中的“好”搭配是合理的，但物品没有快慢之分，显然，主语项“药品”不能和谓语项中“快”搭配。
“该县的环保工作取得了很大成绩，居民的饮水问题也从根本上改善了”这个句子的毛病出在“问题......改善”上。“问题”是主语，改善是谓语。问题可以说“解决”，怎么能说“改善”呢？这就是主谓搭配不当。 并非每一个句子所有的成分都是必须齐备的，这里所说的“残缺”是指一个句子中缺少了某些必不可少的成分。例如，“从大量的研究成果中告诉我们，艾滋病是以患者的血液、唾液、精液等为传播媒介的。”
粗略看一下“从大量的研究成果中”似手是句子的主语。但是，这种介词短语在句子中可以充当状语，不能做主语。介词使用不当，最容易造成主语残缺的语病。修改的办法很简单，就是删去介词“从”和方位词“中”。
2. 逻辑混乱
有时，作者在行文中会产生以偏概全或因果脱节等逻辑上的差错，在阅稿过程中亦应注意思考，及时发现和改正。如在一组研究低温下生物细胞结构受冰晶破坏的文章中，有如下两个句子：“细胞被冷却至-196℃（液氮温度)。”“冰晶破坏了细胞的超微结构图像。”
这里第一句后面括号中的文字说明-196℃的低温是从液氮中获得的，但液氮温度是一个温区，它从氮的液化温度-6℃开始，直到形成固态氮的温度（-211℃），而-196℃仅是这个温区中的一个温度点。
故严格地讲，括号中应写“氮的液化温度”。第二句中，应为“冰晶破坏了细胞结构”，而不是破坏了“图像”，后者与冰晶并无直接因果关系。
3. 文理不通
句子是语言的一个基本单位，安排好文章中的每一个句子，避免各种语病，是写好一篇医学论文的最起码条件。
句子是由词或短语组成的。这些词或短语之间存在着一定的语法关系。如“这家研究所最近研制成功一种新型抗癌制剂”这样一个句子，由10个词组成，这些词又组成了一个个短语，即“这家研究所、最近研制成功、一种新型抗癌制剂”。 句子的中心成分是“研究所研制制剂”。“研究所”是主语，是这个句子的陈述对象，表明“谁”、“什么”。“研制”是谓语．对主语加以陈述，叙述主语的动作行为，表明“做什么”、“怎么样”。“制剂”是宾语，是谓语关涉的对象，回答“谁”、“什么”。
为了使语义更明白、更精确，对句子的主要成分还要加以修饰、限制和补充。但有些论文中，词、短语间的组成不合语法，导致文理不通。
4. 概念混乱
概念是客观事物在人们头脑中抽象的反映，撰写医学论文，概念的应用要正确，否则，就不能准确表达内容。
例如，有一篇文章论述用甲螨检测土壤中汞、镉、铜的污染情况，文题为“应用甲螨检测土壤重金属污染”。其实，重金属不仅包括汞、镉、铜，作者的本意也许是要缩短文题，可是这样一来，既不合事实，又使文题专指性降低。权衡再三，还是改为“应用甲螨检测土壤汞、镉、铜污染”合适。
5. 画蛇添足
有些概念是不言而喻的，加了“修饰”，反而画蛇添足。
例如，近年来，国外工业发达国家热管技术的研究、应用发展很快，中医学能在那样早的年代融进大量物候知识，且有全面记述，这在世界医学史上是少见的奇迹。
“工业发达国家”肯定在中国之外；凡奇迹均属少见。“国外”、“少见”之限制纯粹多余。所以，撰写文稿时，对限制词要谨慎对待。只有那些增加内涵、减少外延、有助期确概念的限制词才能保留。