新冠肺炎疫情蔓延，病毒溯源对人们遏制此次疫情以及预防未来疾病大流行均有重要意义。在病毒溯源议题上，西方社会不少声音指，新冠病毒或可能来源于中国科学院武汉病毒研究所P4病毒研究室。
该揣测未有任何科学理论支撑，因此也遭到了外界诸多舆论反对。
早在2020年2月19日，一批全球顶尖的病毒专家就在著名医学杂志《柳叶刀》 发表声明，“坚决谴责关于新冠病毒并非来自自然界的阴谋论”，坚持科学溯源。
1月5日，法广新闻再刊文分析“不能排除新冠病毒源于实验室泄漏”的重要性，再将矛头指向武汉病毒研究所。
针对外界质疑，武汉病毒研究所的研究员石正丽数次正面回应。
2020年12月23日，石正丽接受BBC采访，表示她愿意接受“任何形式的访问”来排除这种可能性。
2020年9月18日，在北京召开的一场论坛上，石正丽透露，团队研究显示，新冠病毒的自然宿主可能是蝙蝠，也不排除其他野生动物，但中间宿主尚未找到，这也证明，该病毒非常狡猾，从野生动物传到人类社会悄无声息，这个过程也是后续在新冠病毒病原学研究中需要重视的部分。
她回溯了武汉病毒所研究团队开展病毒检测的整个过程，并称完成新冠肺炎病原确定前后只用了40天的时间；而在2013年完成SARS病原确定时间是5个月，这样的快速反应，“得益于我们前期在蝙蝠SARS冠状病毒研究上的15年的积累”。她认为，这也反映了一个道理，如果想做创新，长期积累是必不可少的。
对于如何防范新冠病毒，石正丽认为，目前最简单的办法就是在病毒找到我们之前找到它们，这意味着人类要在自然界提前监测，并开展早检测、早预警、早干预，把一些有可能的传染病阻断在萌芽状态。
据悉，石正丽被称为“蝙蝠女侠”，现任中国科学院武汉病毒研究所研究员，美国微生物科学院院士，武汉病毒所新发传染病研究中心主任、武汉国家生物安全实验室（四级）副主任。
2017年11月，石正丽团队曾发文指，他们发现了蝙蝠中的SARS相关病毒（SARSr virus）是人SARS病毒祖先的更直接的证据。
对于石正丽最新说法，有舆论质疑称，石正丽是研究病毒的，而传播途径这类的问题，是流行病学研究的领域。还有网友指其曾将研究成果送往美国。不过，仍有部分网友对其表示支持。
此前，石正丽曾被传已出逃欧洲向美使馆申请庇护。
不过，其本人于2020年5月2日在微信朋友圈辟谣称，“亲爱的朋友，我和家人一切安好！不管有多困难，都不会出现‘叛逃’谣言中说的情况。我们没有做错什么，我们心中有对科学坚定的信念。一定会有云开日出的那一天。”