新冠肺炎疫情爆发初期,医护人员在抗疫,科学家们在做什么?时至今日,它带来了什么启示?除了今年的国际基因组学大会(International Conference on Genomics,简称ICG),我们很难找到这样一个权威科学界云集场合和机会,一起回顾科学家如何应对未知和恐惧。

ICG始于2006年,到今年已是第15届。放大灯团队(ID:guokr233)受邀参加了本届大会,并在现场给各位带来实况报道。

  • 往年ICG多在主办方华大基因大本营深圳举办,今年则定在武汉,并增加武汉大学等多家联合主办方;

  • 新增女性科学家、青年科学家议程,关注女性与青年科研工作者;

  • 大会新增了COVID-19(新冠肺炎)与其它流行病研究、病原检测、公共卫生与科普等主题环节。同时邀请疫情期间广为人知的高福石正丽张文宏等专业人士做演讲。可以说,今年国际基因组学大会的内容风格因新冠疫情而突变,兼顾了专业性与话题性。

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图丨放大灯团队摄

今年ICG-15移师武汉,其来有自。

一方面,武汉疫情初期,中国科学家快速测定病毒基因序列,为抗疫的决策措施赢得了宝贵时间,本届会议在武汉召开,无论对抗疫还是对科研而言,纪念与象征意味浓厚;

另一方面,也得来点实在的。华大基因与武汉市政府,也在ICG期间宣布了重大合作项目:在疫情期间发挥了重大作用的快速核酸检测设施——华大“火眼”实验室的核心能力和生产制造产业将落地武汉;华大智造智能制造及研发基地项目也将在武汉光谷开工,该项目总投资预计达到24亿元人民币,预计2022年完成一期建成投产。

根据武汉市委书记王忠林在开幕式上介绍,预计2020年武汉生物医药产业规模可超2500亿元。

新冠肺炎是会议主要话题之一。会议首日(10月26日),放大灯团队(ID:guokr233)自现场发回专业人士高福(中国疾病预防控制中心主任)和张永振(上海公共卫生临床中心研究员)的演讲精粹。

高福:

科学家曾预测到疫情,但我们都没做好准备

在新冠疫情期间陷入“抢发论文争议”[1],并建议CDC进行改革的中疾控主任、中科院院士高福,在开幕当日以连线形式作了演讲。高福认为,对病原体基因组的研究非常重要,并特别强调:

第一,新冠疫情是挑战,此前科学家已预测到类似疫情的暴发。此前科学家就预测人类会遭遇冠病毒或流感病毒引发的(全球性)疫情,这次就是新冠病毒。新冠疫情是黑天鹅事件,我们都没做好准备,但是科学们此前已经在呼吁要做好准备。

第二,合作很重要。今年1月8日时,包括CDC、中国医学院等五六个小组就合作找到了新冠病毒的全基因组,实现了非常快的数据分享。

第三,数据分享是关键。要战胜像新冠这样的重大挑战,“基因组数据的分享是一切工作的开始,尤其是对病原体控制而言。

第四,疫苗是关键。有疫苗才能够控制像这样的一些造成公众紧急事件的病毒传染。通过疫苗——种牛痘,人类几乎已经解决了小儿麻痹症。疫苗的制备、准备研发都非常重要。我们已以史无前例的速度,紧锣密鼓地研发疫苗。

第五是团结。“政治家、科学家、学者们要做好合作的准备。没有一个国家、没有一个人能够在像新冠疫情这样的大挑战面前独善其身。”

高福最后强调,还是要寻找中间宿主。人们现在认为中间宿主可能是蝙蝠或者果子狸等,但实际上还没有在蝙蝠身上发现同样的病毒,不同蝙蝠之间携带的病毒也有所不同。因此,还必须做更多的科学工作和数据分享。

此前,武汉病毒所石正丽团队研究表明,新冠病毒来源指向蝙蝠 [2]。本届ICG大会上,石正丽也将做主题演讲,欢迎和放大灯团队一起紧跟议程,关注石正丽的演讲。

张永振:

我们何时能像天气预报那样预测疫病爆发?

与张文宏、石正丽、高福等人不同,在疫情期间,复旦大学附属上海公共卫生临床中心张永振教授相对低调,受到公众关注不多。张永振是首先测得新冠病毒基因序列的人(也因此被《时代》周刊评为“2020年最具影响力的人物”之一[3])。

张永振团队发现了多种新型RNA病毒(WhenZhou Virus、JingMenVirus等),已经证明这些病毒可感染人类。迄今为止,国际病毒分类委员会(ICTV)确定了病毒的14个目,其中就包括张教授团队发现的3个目。

在“我们何时能像天气预报那样预测疫病爆发”(When could we predict the the emergence of the infectious diseases like weather forecast?)的主题演讲中,张永振表示,目前对病毒的了解还十分有限。同时披露了疫情初期,他的团队参与新冠病毒(SARS-CoV-2)基因序列测定的细节。

复旦大学附属上海公共卫生临床中心张永振教授丨放大灯团队摄

今年1月3日下午1点30分,自武汉采集的肺支气管肺泡灌洗液被送往张教授所在的上海公共卫生中心所在的实验室。

1月5日早上7时,这种SARS样病毒的全基因组序列被破解

张永振教授和武汉中心医院的同行讨论后,得出了初步结论:这种病毒是类似于SARS的一种新型冠状病毒;引发的病症比高致病性禽流感更严重;它会通过呼吸系统传播

包含着这些判断和控制措施建议的报告随即被送往北京和上海有关部门。同日,张永振教授团队向美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)建立的DNA序列数据库GenBank释放了这种新型冠状病毒的基因序列。

张教授把这段经历总结为:“常规科研,偶然发现。事关重大,立即上报。”

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张永振团队于1月5日完成新冠病毒测序,推测病毒可以通过呼吸系统传播,并将结果上报有关部门丨放大灯团队摄

此外,大会首日,许多专家都提及了基因组学的研究在于疫情防控、疾病治疗乃至生育筛查等方面的重要性,这也正呼应了本次国际基因组学大会的主题:Omics & Global Health(组学与人类健康)。

本届ICG大会将持续至10月30日,在接下来几天,放大灯团队将持续跟进和记录石正丽、张文宏等人的演讲。欢迎读者们关注!

[1] 中国科学报:“抢发论文”?赵国屏院士:莫用随意“推理”攻击抗疫勇士
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2020/1/435282.shtm

[2] Zhou, P., Yang, X., Wang, X. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature579, 270–273 (2020).
https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7

[3] Time: The 100 Most Influential People of 2020
https://time.com/collection/100-most-influential-people-2020/5888191/zhang-yongzhen/