灯塔十二年，猎荒者部队在地面任务时遭遇毁灭性打击， 并且只有一个人！
这段资料记载于灯塔的资料室中，马克和冉冰在查找地面信息时偶然发现了这段历史。由于灯塔十二年太过久远，灯塔上有资历的老人只剩下尘民0609。
将马克和0609的对话提炼可得到以下信息：
1. 灯塔十二年根本没被入侵。
2. 当年摩根还是猎荒者指挥官时被地面噬极兽围攻，后被一副黑色机甲所救，机甲的驾驶者是一个银发美女。
3. 摩根请银发美女上灯塔，后机甲和美女都莫名消失了。
除了第三点是0609无意间透露的，1、2两点显然与资料室的档案记录相悖。从0609的身份和表现看，他并不存在说谎的立场，很明显是灯塔在篡改事情的真相。
十二年到底发生了什么？黑色机甲和银发女为何会消失？
十二年的入侵指的是摩根邀请银发女上灯塔
按0609的说法，灯塔十二年根本没有被入侵，那么能上灯塔的其他势力只有银发女了。
银发女代表地面势力，摩根代表灯塔势力。从后期摩根对“地面人类”的态度而言，当年肯定发生了一些不愉快的事情，大概率是“人类发展理念”不合。
从整部动画内容而言，地面势力和灯塔势力走的的确是两种不同的“科技树”。灯塔主张自然的基因优化，通过创造优质人口对抗玛娜生态。地面势力的科技方向暂时不明，但从地面六人组的行为看，多少都有些玛娜生态的影子，极可能是融入生态。
双方势力的不愉快也许不仅仅是口舌之争，极可能引起了械斗。所以这段历史被修改为“十二年灯塔被入侵”。
临渊计划的冰封机甲就是黑色重力体
摩根在得知马克在地面遇到人类后，安排重启了临渊者计划。维克多将军在嘉丽博士的实验室中打开了冰封临渊者计划的设备，在合上的瞬间可以看到临渊者的正面，其面部几乎与灯塔十二年发现的银发女机甲一样！
所以当年机甲消失就是被摩根藏了起来，并制定了“临渊者计划”。
结合0609的话：摩根邀请银发美女上灯塔，后机甲和银发女都消失了。
在第三集中，维克多将军曾问摩根：“城主大人，您觉得会是她吗？”这句话可以推测，当年冲突后，虽然黑色机甲被留在了灯塔，但银发女通过特殊手段成功逃离。
嘉丽博士如何能驱动临渊者？
第一代银发女当年逃离了灯塔，那么谁能驾驶黑色机甲？这点做2点猜想：
1. 基因克隆人技术，再造一个银发女。
2. 靠银发女的基因样本让机甲判定驾驶员为银发女。
猜想1基因克隆。在嘉丽博士的房间里，有一个实验罐是空的，马克是04号实验体，那么03号实验体去哪了？会不会就是银发女的基因克隆体？既然在医疗采集点出现了马克的克隆体，那么以灯塔的资源克隆一个银发女也不是很难的事。
猜想2以银发女基因样本让机甲判定驾驶员为银发女。这点可以这么理解，就像重力体能识别驾驶员一样，黑色机甲也能靠基因识别驾驶员。
同时，嘉丽博士提到启动临渊者需要特殊的材料。
如果是猜测1，那么需要的可能是激活克隆人的特殊物品，比如克隆人处于类似的“惰性状态”，虽然存在生命体征，但无生命活动迹象。需要用特殊的材料唤醒，像生命源质，或类似胖子灵引弹的物质。
如果是猜测2，则是需要银发女的基因样本。这几十年间由于缺少银发女基因样本，导致临渊者计划一直停摆，马克的信息表明地面还有类似银发女的人类，给临渊者计划重启提供了可能。
无论哪种猜想，摩根的最终目的都是重启临渊者计划。
后记
虽然现在临渊者计划的具体内容尚未清楚，但既然涉及到黑色机甲就肯定和地面势力有关。灯塔也许是看上了黑色铠甲的强大科技，也许是想了解不同科技树的产物可否为灯塔带来希望。
而摩根就是这幕后的操纵者，也许马克基因差异的背后也有他的影子。所以虽然摩根将城主之位让给了查尔斯，但只要临渊者计划还掌握在他的手中，他就会重临《灵笼》的舞台。