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SARS-CoV-2病毒颗粒模型图(图源:medicalxpress.com)

王雷编译

近日,美国新墨西哥州洛斯阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory)的工作人员及其合作者发现,新冠病毒(SARS-CoV-2)已发生基因突变,其突变株D614G提高了感染人类细胞的能力,成为世界范围内流行的主要病毒株。

该研究发表于《细胞》期刊,文章题目为“Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence That D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus”。

新冠病毒突变株D614G

COVID-19疫情爆发后,其病毒株持续演化变异,各国研究团队一直致力于研究该病毒的变异情况。本次研究的主要人员来自美国新墨西哥州洛斯阿拉莫斯国家实验室、北卡罗来纳州的杜克大学(Duke University)以及谢菲尔德大学(University of Sheffield)的疫情小组。

最新发现的新冠病毒突变株被称为“D614G”,突变点位于棘状蛋白(病毒外部的一种结构,病毒通过该蛋白可以入侵人体细胞)的表面,与邻近的原聚体形成接触。

该突变株使病毒的棘状蛋白增加, 并使这些蛋白更稳定,进而使病毒更容易入侵人体细胞。 毒株扩散的可能原因包括:D614G突变株感染能力非常强,感染能力强的毒株可以通过扩散,迅速压过感染能力弱的病毒株。

SARS-CoV-2棘状蛋白晶体结构图(图源:livescience.com)

美国科学家威廉·海瑟廷(William Haseltine)指出,D614G突变株使得病毒的传染力提高了约10倍,但与疾病严重程度之间没有显著关联性。科学家担心,即使感染过新冠病毒的患者体内存在抗体,也会受到D614G突变株的感染。

D614G突变株的主要特点:

· 在多个国家和地区范围内快速增长,适应性更强;

· 具有更强的传染性以及更高的病毒载量;

· 与COVID-19的感染严重程度无关;

· 可能会降低对个别恢复期血清的中和敏感性。

研究人员指出,D614G突变株的高传染性可能是其迅速传播的原因。据统计,全世界一半以上的新冠病毒株,几乎都是变异的D614G。

根据中国疾病预防控制中心发布的 北京新发地新冠病毒基因组序列 数据, 研究人员通过比对确诊病例的病毒基因组序列发现,样本序列均 存在D614G突变情况。

基于GISAID数据库的研究

研究人员通过分析全球共享流感数据倡议组织(GISAID)上发表的病毒基因组样本,发现D614G首次出现后很快就成为了主要病毒株,而且病毒种群从原始病毒转移到了突变病毒。

GISAID是目前全球最大的流感及新型冠状病毒数据平台,其数据来源于全球14000名研究人员和1500个机构,在抗击严重急性呼吸综合征(SARS)、甲型HIN1流感、人感染H7N9禽流感、COVID-19等疫情中发挥了重要作用。

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D614G已成为当今世界范围内流行的主要病毒株

研究人员正在通过GISAID数据库提供相关的病毒序列数据,或许可能在全球范围内追踪SARS-CoV-2的进化情况,通过更广泛的测序和临床数据,以及改进的统计模型,确定该突变病毒株的全部含义。

COVID-19的基因组流行病学(图源:www.gisaid.org)

目前,世界各地的研究团队正共同努力,积极开展新型冠状病毒的相关研究(包括病毒的自然史、流行病学、疫苗、诊断试剂、治疗工具等),以便更好地了解SARS-CoV-2的特性,为尽早结束新冠疫情提供帮助。

参考文献:

https://medicalxpress.com/news/2020-07-infectious-strain-covid-dominates-global.html

https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0092867420308205