实际上可能也很简单，这90多人也基本上都是名校博士毕业，集体辞职可能就是想找一个更好的地方去干了。现在的中科院合肥物质研究院核研究所可能也没有前些年项目多，效益好，这样集体辞职可能也算是正常的事情了。
核研究所这些年项目减少
从公开的媒体报道来看，这几年核研究所的项目是越来越少了。而前些年核研究所项目多的时候，人员最高达到了将近500人，到这两年可能是项目少了一些，因此，这几年人数都在减少，等到6月份这90人集体辞职以后，大概核研究所也就只剩下100人出头了。
这几年，核研究所可能并没有能够争取来更多的研究项目，这样可能科研资金投入就会减少不少，有些科研人员可能就没有多少活干了，这样可能科研人员的奖金收入可能就会下降，有些科研人员可能就会想着离开了。
可能是被挖走的
根据核研究所内部回应，说这些研究人员是被挖走的。这样的说法也是可能的，合肥核研究所里面的人才基本上都是国内顶尖名校毕业的博士，很多都是中科大的博士，可以说科研能力是非常强的。
而且这些博士基本上也都是刚毕业没几年，正是30左右的年龄，正是向上奋斗的时候，如果核研究所科研项目在国内国际比较顶尖的话，这些人才也有可能被一些其他企业高薪挖走继续做科研。因此，这些科研人员也有可能是被高薪挖走的。
究其根本，可能还是待遇问题
辞职的根本可能还是待遇问题。核研究所的工资待遇还是不错的，基本上中规中矩，这些科研人员年龄大多在30岁左右，在核研究所能够拿到月薪1万多，可能大部分有事业编制，还能够分福利房。这样的待遇对于普通人来说，可能还是相当不错的，但是对于国内名校毕业的博士来说，如果横向对比，这样的待遇可能就稍微有点低了。
如果这些博士能够做一些国内国际顶尖的科学研究的话，那么可能出去以后，就有可能赚到年薪几十万，甚至更多，那么在核研究所的待遇相对来说就有点低了。
现在我国有很多公司工资待遇是很高的，比如华为公司平均工资能够达到70多万一年，阿里巴巴和腾讯平均工资也能够达到70万左右。因此，辞职的根本可能还是待遇问题。
结论
综上所述，中科院合肥核研究所90多人辞职的原因可能也很简单，可能就是待遇问题，这两年核研究所项目较少，可能奖金会减少，还有就是外边可能有人高薪聘请，这样这些科研人员可能就辞职了。