驱瘟辟邪，是端午节的重要内涵之一。某些特殊植物由于本身的药效、象征，而成为端午节具有辟邪意义的物品。其中以菖蒲与艾草最具代表性，两者常同时并用。
《荆楚岁时记》中记载，将菖蒲切碎入酒饮用，以强身保健，避免恶疾；以艾叶作为人形，叫做“艾人”，将其悬于门户之上，可禳除毒气；作为虎形佩戴，称为“艾虎”，具有驱瘟辟邪的效果。
可见，菖蒲、艾草辟邪意义之由来，主要是其本身的药效功能。
《本草纲目》中的菖蒲与艾草
华南地区春夏之交，气候湿热。这种气候，容易使人出现风寒湿痹、气滞难通等病症。此外，湿热的环境亦容易流行疟疾、瘟疫等传染病，以及食物腐坏所引起的腹疾、下痢等病。
而菖蒲原产于长江流域以南各省，在华南地区是常见的药用植物。
夏季是菖蒲生长最旺盛的季节；艾草虽处处有之，但亦以夏季为采收期。而两者自然成为端午节的应时节物。
菖蒲
《本草纲目》说菖蒲辛温香窜，针对风寒湿痹以致四肢无法伸屈的症状有特别疗效，且又解气闷，通心窍，宁心安神，令人耳聪目明，对防瘟杀虫亦具作用。
《本草纲目》又说艾草具有保温、安定神经、诸虫咬伤、止痢和止血、辟风寒等功效，尤其将陈艾用在炙敷上，药效最佳。且艾叶也以端午前后二十天采撷者公认品质最优，这段时间的艾叶香气浓，功效显著。
菖蒲与艾草的象征意义
菖蒲与艾草等植物之辟邪功能，除了来自于本身药效，另一方面则来自于其象征意义。
《本草纲目·典术》云：
“尧时……感百阴之气为菖蒲……方士隐为水剑，因叶形也。”
菖蒲之所以有辟鬼驱邪的功能，主要来自于其叶形。菖蒲的叶形尖耸，竖立似剑形。剑，可杀敌卫身，而让人联想其可以斩杀百鬼邪气，保卫己身。
持剑驱鬼
根据“同能致同”、“同类相生”的原理，古人认为相似的东西可以互相感知，因此菖蒲如同宝剑，具有辟邪斩鬼之用。
至于艾草，其叶形似旗，能帮助持剑的将军招兵买马，形成辟邪大军，因此有端午门联句曰：“蒲剑冲天皇年现，艾旗伸地神鬼惊。”显示出菖蒲、艾草具有驱邪的功能。
另有一说，则以为艾草形似人掌，配合菖蒲，正如手持宝剑斩鬼辟邪之貌。艾草与菖蒲恰为一组辟邪主题，借着形似而达到象征斩杀百鬼的意象。
艾草
除了菖蒲与艾草，端午节时古人还会用什么植物？
以菖蒲、艾草作为端午节物，传至宋代后，随各地风俗不同，使用的辟邪植物亦不同，有时会互相搭配而发展出诸多样式。
最一般的方法，是将其悬挂于门户或佩戴于身上，如《东京梦华录》云：
“自五月一日及端午前一日，皆卖桃、柳、葵花、蒲叶、佛道艾。次日家家铺陈于门首……又钉艾人于门上。”
人们相信将菖蒲与艾草悬于门户或佩戴在身上可以除不祥、怯邪鬼。
除了菖蒲、艾草，有时还会搭配萱、葵、蒜、桃、桃梗、榴、楝叶、柳等植物，以增强辟邪的效果，而其辟邪功能主要来自于本身的药性及象征意义。
李时珍画像
萱草，《本草纲目》云“怀妊妇女佩其花，则生男。”由于萱草于五月开花，是应时的植物，而其又具有求子的象征意义，所以也成为端午节的节物。
葵，《本草纲目》载其功效：“除客热，治恶疮，散浓血。”由于夏季湿热，易导致气闷积滞、恶疮等病症，而葵之药性正好解除这些症状，故亦成为端午节应时植物。
蒜，我们都很熟悉，因具有“除邪痹毒气，主溪毒，下气治蛊毒”的实际药效，而成为端午节的节物。
关于桃及桃梗，《本草纲目》记载它们皆有一定的药效，加上桃象征子孙繁茂，与“羿死于桃棓”的传说，使桃与桃梗具有辟邪、灭绝百鬼的象征意义。
石榴花
石榴花，是五月应时之植物，加上其本身治腹痛、止泻等药效，与果实多子的象征意义，使其成为端午节应时的辟邪植物。
楝叶，主治“温疾伤寒，大热烦狂，杀三虫疥伤。”而且传说龙惧楝叶，故民间使用楝叶包粽子，可辟不祥。
柳，民间俗信柳枝可以驱邪，因此在巫术仪式中，柳枝常扮演法器的角色。其驱邪的意义，是其成为端午节物的原因。
古人如何使用菖蒲与艾草？
一般方法是悬挂。除此之外，还有更仔细的使用方法。
菖蒲、艾草
古人会将菖蒲、艾草及其他辟邪植物，加工成各式形状。除了辟邪驱鬼的实用功能，也兼具美观与玩赏功能。如《岁时广记》中记载：
“作张天师，以艾为头，以蒜为拳，置于门户之上。”
“端午刻菖蒲为小人子或葫芦形，带之辟邪。”
自宋代，菖蒲、艾草的运用更多样化，通常结合其他辟邪图像一起使用。
归结而论，随着各地风俗不同，艾草常作为人形、虎形、五毒之形。而菖蒲也常雕刻为葫芦形、天师驭虎与百虫之形，与艾草一起悬于门户或床户。