在贝尼特斯漫长的执教生涯中，瓦伦西亚是相当重要的一站，在执教瓦伦西亚的3个赛季间，贝大师率队拿到了3座重要奖杯：2个西甲冠军、1个联盟杯冠军。其中在2001-02、2003-04赛季，贝尼特斯都率瓦伦西亚拿到了西甲冠军，稳固的防线是夺冠的关键。
2001-02赛季时，瓦伦西亚、拉科鲁尼亚、皇马、巴萨都是西甲冠军的有力争夺者，最终，21胜12平5负积75分的瓦伦西亚笑到了最后，拿到了西甲冠军。瓦伦西亚的防线相当稳固，38轮只丢27球，是丢球最少的球队，当时球队的主力门将是西班牙国门卡尼萨雷斯，后卫线上有经验丰富的卡博尼、佩莱格里诺、阿亚拉、安格洛马。防线稳固的瓦伦西亚，在进攻端则并不犀利，阵中有艾马尔等中场球员的瓦伦西亚38轮过后只打进51球，在这个赛季西甲射手榜前列，根本看不到瓦伦西亚球员的身影，队内的最佳射手是进7球的中场球员巴拉哈。由于受到伤病困扰，西班牙国脚巴拉哈在这个赛季西甲只出场17次，打进7球，进7球的他已是瓦伦西亚队内的最佳射手。
在2003-04赛季，贝尼特斯再次率领瓦伦西亚拿到西甲冠军，战绩为23胜8平7负积77分。38轮过后，瓦伦西亚依然只丢27球，当时瓦伦西亚在防线上有卡尼萨雷斯、卡博尼、佩莱格里诺、阿亚拉、马切纳等球员，在后腰位置上则有巴拉哈、阿尔贝尔达这对铁腰。防线稳固的同时，瓦伦西亚这个赛季在进攻端火力全开，38轮过后打进71球，阵中的前锋米斯塔与边锋维森特在这个赛季大放异彩，其中米斯塔在这个赛季西甲打进19球，位列西甲射手榜第三。
除了在西甲夺冠外，瓦伦西亚2003-04赛季还拿到了联盟杯的冠军，球队在决赛2-0战胜了阵中拥有德罗巴的马赛，维森特、米斯塔各进1球。
在20世纪90年代末至21世纪初的这几年间，瓦伦西亚俱乐部迎来了巅峰期，当时的他们在西甲、欧洲赛场都极具竞争力。在此后的十几年间，瓦伦西亚几经沉浮，流失了大量个人能力突出的球星，球队的整体实力也下滑了不少。
瓦伦西亚，何日复兴？