随着日本宣布多个地区进入紧急状态，日本的两大航空公司日本航空和全日空航空公司，同时宣布调整期航班时刻表，对运力进行大幅度削减。
根据外媒《商业旅行者》的一份报告，日本此次宣布的紧急状态将持续一个月。不过和其他国家不同，日本的紧急状态并不会看到严格的隔离措施，以及企业倒闭的情况。
根据《日本时报》的报道，地方县政府无权实施封锁，他们只能要求关闭电影院，学校和商店等设施。但据媒体报道，日本公众和政府都对新冠病毒的全球大流行感到不安。
日本的确诊病例正在以每三天新增约1000例的速度增长。对于疫情遏制失败的情况，日本首相安倍晋三表示，应对疫情的政治判断“责任在自己”。
7日，安倍在记者会上曾被问及“为何避免举办活动和学校统一停课未能遏制疫情蔓延，导致发布紧急事态宣言”，他当时回答称，这“并非是说由我承担责任就行的事情”。而他在9日的再次回复，则修改了前次发言的表态。
安倍在承认自身责任的基础上表示，“应当防止（疫情）发展为危及生命的最坏事态”，他还呼吁，“希望严格避免会导致疫情扩散的人员移动等行为”。
数据显示，受到新冠疫情的影响，日本繁忙的国内航空业也在放缓，3月底日本航空已取消了3,000多次国内航班，竞争对手全日空（Nippon Airways）取消了约2250架国内航班。
日航在周二发表的一份声明中说；“当政府官员今天宣布日本多个县进入紧急状态时，日航将减少额外的航班，以应对预期的旅行需求下降。”在四月份，日本航空平均将其国内运力削减了25％。
全日空航空公司表示，它将在四月份削减1742个航班。它将影响48条路线。东京羽田机场的进出航班将首当其冲。进出东京成田，伊丹，关西，名古屋，札幌，福冈，广岛和那霸的航班也被削减。
不过相比于全球的其他大型航空公司来说，日本的这两家航空公司在运力裁减上并未采用停飞航线的方式，而是选择了减班。
据估计，全球大流行将使这两家日本航空公司损失93亿美元。2020年的大流行给日本航空业带来的冲击远远超过了SARS。一位当地航空业内人士告诉《日本时报》，这是前所未有的。
“我们从未见过对国内航班需求的急剧下降，这是日本航空公司稳定收入的来源。我们看到航班上的乘客只有一位数。”
日本政府在发布紧急状态公告的同时，也发布了一项总值高达1,000亿美元，针对企业与家庭的经济刺激计划。不过是否会针对诸如日本航空和全日空这样的大公司提供救助，目前还尚不可知。
随着日本政府越来越多地要求其公民留在国内，日本对国内航空旅行的需求仍将在一段时间内保持低迷。