一名科学家周三说,新冠病毒从2月份就开始在纽约市蔓延,而当时还没有开始大规模检测,目前在当地样本中发现这种病毒来自欧洲。
领导这项研究的纽约大学格罗斯曼医学院遗传学家阿德里亚娜·海居伊告诉法新社记者,追溯病毒的传播链将有助于政策制定者在未来做出更明智的社会干预。
她说:“很有意思的是,到目前为止,大多数似乎都来自欧洲,我认为这在一定程度上是因为人们关注于阻止来自中国的游客。”
她补充说,这些发现还与纽约医生在该市开始大规模检测之前治疗的一系列神秘肺炎病例有关。
海居伊和她的团队从Tisch医院、纽约大学温斯洛普医院和纽约大学兰格尼医院的病人的鼻拭子中提取了75个样本,测定了这些样本的病毒序列。
所有的生物体都会随着时间发生变异,但所谓的RNA病毒,如SARS-CoV-2,会在每个复制周期中引入错误。
这就是为什么流感病毒在不同季节差异如此之大,需要新疫苗的原因。
虽然这种新型冠状病毒的变异速度似乎不如流感那么快,但它的变化足以让科学家追溯到它的祖先,就像一个人的DNA可以追溯到他们的父母和祖父母一样。
为此,纽约的研究小组将他们采集的样本上传到全球流感数据共享计划(GISAID EpiFlu)运行的服务器上,来自世界各地的科学家在服务器上共享数据。
他们研究的第一个病人没有相关的旅行史,这意味着他是被社区的人感染的。
他说:“根据病毒发生的具体变化,我们基本上可以断定,这种病毒很有可能来自英国。”
除了确定传播途径外,继续收集更多数据还可能具有临床意义。
例如,科学家们最终将试图了解一些菌株是否比其它菌株导致更少或更严重的疾病,这可能为有针对性的治疗提供信息。
另一个可能的用途是,当各国恢复工作并解除封锁限制时,就像中国和韩国开始做的那样。
如果像科学家们怀疑的那样,这种病毒是季节性的,并以较小的第二波传染再次回归,他们可以立即对受感染患者的基因组进行排序,然后从他们居住的社区采集样本,以确定是否发生了社区疫情。
这反过来又有助于更有针对性的社会干预。
该团队目前处于项目的早期阶段,但希望很快能每周对近200个样本进行测序,目标是提供数千个基因组供分析。
原文来源:https://medicalxpress.com/news/2020-04-coronavirus-nyc-february-europe.html