新型冠状病毒肺炎疫情发生以来，为坚决贯彻落实市委、市政府加强新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控工作要求，上海轨道交通建设区域迅速开展工作部署，采取多项措施，持续强化依法防控、科学防控、联防联控，坚持“三个全覆盖、三个一律”，坚决切断传染源、阻断传播途径，切实扛起疫情防控责任，全力做好各项疫情防控工作，在打赢疫情防控阻击战的同时，努力完成全年建设任务目标。
组织机构保障
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轨道交通建设工程各施工项目成立疫情防控小组，明确职责，建立防控体系，关键岗位人员实行专人专岗，明确相应岗位职责，并落实专人对接属地社区管理部门、疾控部门。另外，施工现场设立专职卫生员，负责监测体温、通风消毒、发放并监督使用个人防护用品、宣传教育等。
人员管控保障
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在工地入口设立健康观察点，对所有进场人员实施体温检测，按规定要求对进场人员填写《上海轨道交通建设工地新型冠状病毒感染的肺炎疫情期间来沪（返沪）人员健康信息登记表》，核实身份证号、手机号码等关键信息，关键信息应及时与属地社区共享。
有相关流行病学史（包括湖北等重点地区旅居史，曾与重点地区发热或呼吸道症状人员有接触史、曾与新型冠状病毒感染的肺炎病例有接触史）的，必须居家或集中隔离观察14天。同时，各施工现场责设置符合防御标准要求的隔离室或隔离区域（包括餐饮、厕所、洗漱、晾晒等）。
严控施工现场
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一是严格实施现场全封闭管理，施工现场和生活区24小时单独设岗，建立进出场登记和体温检测制度。
二是依照《关于下发九个重点场所预防性消毒技术要点的通知》（沪疾控传防〔2020〕32 号）技术要求，对施工现场、办公生活区域（工地食堂、宿舍以及厕所等场所）及其他人员活动场所开展预防性消毒，保持室内空气流通，落实环境消毒制度。
三是在施工现场和生活区显著位置张贴卫生防疫宣传广告，提高现场人员的防控意识，自觉做好自身防护，疫情教育交底应深入到每一家进场单位、每一个进场人员。
防疫物资准备
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施工现场配备足够的口罩、测温计、消毒液等疾病控制用品，储备确保一周用量，且有保证连续施工的防疫物资采购渠道。