一般来说，夺权者一旦成功，都会对政敌进行斩草除根。尤其是政敌的儿子，绝对不能让他们存活下来。因为存活下来，就意味着他们可能会报仇雪恨。即便他们不报仇雪恨，也难保有许多别有用心的人，会打着这些后代的旗号，起来造反闹事。
比如历史上有名的“玄武门政变”中，李世民杀掉李建成和李元吉后，立刻就把他们两人的后代抓起来，杀得干干净净。
(靖难之役）
那么，朱棣在靖难之役中杀到南京，推翻了朱允炆的统治，强占了朱允炆的皇位以后，他是怎么对待朱允炆的两个儿子的呢？
朱允炆一共生了两个儿子，长子朱文奎两岁的时候，朱允炆登基当皇帝。朱允炆当了皇帝以后，立刻就立朱文奎为太子。次子朱文圭在建文三年的时候出生。
当朱棣在建文四年打进南京城的时候，朱允炆才7岁，朱文圭才2岁。
朱棣在谷王及李景隆等一众叛乱大臣的帮助下，不费吹灰之力，就打进了南京城里。那时候，朱允炆还在宫中。不过这时候，朱允炆生活的宫中突然燃了起来。等朱棣赶到现场的时候，只看见了几句烧焦的尸体，太监说，那是皇帝朱允炆、皇后马氏及皇太子朱文奎的。朱棣也以这个定了案。
可以确定的是，朱文奎和马皇后肯定是被烧死了的。毕竟一个是孩子，一个是女人。就算烧死了，特征也很明显，可以从尸体上辨认出来。但是朱允炆究竟到哪里去了，在历史上一直是一个谜。很多史学家都推断说，朱允炆应该当时是逃走了。只不过逃到哪里去了，并不确定。
（朱允炆画像）
不过，我倒觉得，朱允炆逃走的可能性小，很可能他真的就在那时候死了。那几具烧焦的尸体，很可能有一具就是他的。为什么这么说呢？
因为朱棣虽然打进南京城了，但实际上，他的问题并没有完全解决。他想要当皇帝，并没有那么容易。当初他之所以造反，是按照《皇明祖训》上的说法，打着“清君侧”的旗号进行的。也就是说，是皇帝身边出现了一些奸臣，他需要进京，把这些奸臣给除掉。如果他杀进京城后，把皇帝给杀掉了。别说杀掉，哪怕替代了朱允炆当皇帝，他都没办法交代。
所以，他最好的办法，就是在见到朱允炆之前，必须先让朱允炆死掉。
要怎么让朱允炆死掉呢？派人杀他，当然可以。但是杀掉他后，天下人必然怀疑他。要想让天下人不怀疑，唯一可行的办法，就是让他“自焚”。
由此可见，皇宫中的那把火，很有可能就是朱棣的人放的。毕竟当时谷王和京城的守将李景隆已经和朱棣勾搭在一起了。谷王和李景隆要害朱允炆，或者放朱棣的人进去害朱允炆，也是很方便的。
而且，为了避免朱允炆乱跑乱叫，朱棣的人很可能先杀掉朱允炆夫妇及太子朱文奎，然后再放火烧。那时候没有法医，不可能检查出朱允炆等人是先被杀死后再放的火。
（朱棣夺权）
后世的史学家出于一种美好的愿望，觉得朱允炆不能就那么死了，因此才有朱允炆已经逃掉的猜测。
朱允炆死了，太子朱文奎肯定也活不了。因为朱允炆去世，就意味着该太子当皇帝。如果是那样的话，朱棣就没有机会了。
朱允炆的另外一个儿子朱文圭还活着，很有可能是因为当时朱文圭在奶娘手里，没和朱允炆在一起。没在一起，如果也被害死的话，那就露馅了。所以朱文圭活了下来。
不过，朱文圭虽然活了下来，但其实也起不到什么作用。一来他不是太子，二来他还小。
当然了，就算他还小，朱棣也不可能让他逍遥快活。朱棣把他废为庶人（他也因此叫做“建庶人”），随即，朱棣把他送到凤阳，关闭在一个宫殿里，周围派重兵防守起来。就这样，朱文圭从2岁开始，一直在那个小小的宫殿里，活到了57岁。其间没有读书的机会，没有见人的机会，乃至于没有认识大自然花草树木的机会。史料上说，当他57岁被放出来时，他甚至连牛和马也无法分辨。这是一种多么可怕的禁锢啊！
朱文圭57岁的时候，当时的皇帝明英宗偶然想起来，出于怜悯，把他放了出来，同时还让他结婚生子。朱文圭被放出来的时候，“且悲且喜”“无限感激”。不过，这样的日子他没过几年，很快就去世了。
（参考资料：《明史》《明实录》）