16世纪中叶，全世界掀起了一场香料贸易的狂潮，到了16世纪末，为了追寻最大的利益，荷兰、西班牙等殖民国家开始在东印度建立公司，并用武力征服了周边的海岛国家，建立香料王国，1619年，荷兰人占领了爪哇巴达维亚城。到了17世纪末，随着殖民贸易的兴盛，劳动力不足的现象越发显著，荷兰、西班牙等殖民者开始四处掠夺人口。1684年，清政府开放海禁，华人得以源源不断来到荷兰殖民者控制的巴城。
到了18世纪初，随着劳动力到不断涌入，爪哇巴达维亚城到人口越发充足，组建形成了一个城邦，而且随着人群的聚集，爪哇岛上出现了四种不同性质的“反荷运动”，在当地有一定影响力的华侨也支持了一些反荷势力，而且随着华人的不断涌入，再加上当时清朝的威慑力，荷兰人对当地华人有很强的戒备心，为了维持绝对的统治力，荷兰人开始限制爪哇岛上的华人数量，并严格控制流入的华人。
华人十分勤劳，而且喜欢攒钱，在巴城工作的华人群众中，逐渐诞生了一些富豪，华人的实力和财力以及影响力也得到了增强。到了1727年，荷兰人出台了一个政策：当地华人必须取得居住证才能获得巴城的居住权，不然全都要被驱逐出境。荷兰人想要用这种办法，分离华人，排斥走有威胁的华人，留下听话能干的华人。
从1739年到1740年初，荷兰队华人的政策越发严苛，在巴城生活的华人必须一遍又一遍地去申请居住证，有时华人还会以莫须有的罪名被逮捕，受尽毒打，还要交一笔钱才能释放出狱。荷兰人的行为，引起了华人的强烈不满，华人群体的反荷情绪高涨，并在暗地里密谋起义。每每到了这里，似乎都会出现一个汉奸。当时有一个叫林楚的人，跟荷兰人告了密。
1740年10月，荷兰人用搜查军火和逮捕盗贼到名义，强行进入当地华人的家里，肆意掠夺财物，并对当地华人实施了大屠杀，一万多华人，最后只有一百多人侥幸逃出，其余人全部荷兰屠杀了。因肇事地点之一为城西一条名为红溪的河，故称为红溪惨案。这是一起极为恶劣的事件，红溪惨案不仅受到了西方各国的谴责，就连荷兰本国都对这起事件的负责人提起了公诉。荷兰东印度公司总督Adriaan Valckenier先被撤职，并没收一切财产，最后被判处死刑。
荷兰人对红溪惨案如此看重，并非是良心发现，而是因为当时的清朝影响力很大，荷兰人为了平息清朝的怒火，才主动处理了责任人，然而清朝当局的反应却让荷兰人始料未及。1740年也就是乾隆五年，当乾隆得知这件事后，十分生气破口大骂，只不过乾隆是骂那些华侨，而非施暴的荷兰人。
乾隆说：“自弃王化，系彼地土生，实与番民无异”，“内地违旨不听召回，甘心久住之辈，在天朝本应正法之人，其在外洋生事被害，孽由自取。”一句话总结就是：连故土都不愿待，却跑到国外惹事生非，死得活该！不过最后乾隆又说：“事属可伤，实则孽由自作。”的确很可怜，但这一切都是自找的。
荷兰最后还专门向清朝发来了道歉的文书，但这件事已经被定了调子，最后清廷也给了回复，大致意思就是说“海外华侨都是罪人，草芥不如，遭此巨难，孽由自作，无关朝廷痛痒。”
那时的清朝还自称天朝上国，故此乾隆对自己的子民远离故土的行为十分生气。红溪惨案发生时，正值乾隆盛世，如果是盛世百姓又为何远离故土，在海外谋生？谁不想在家就能过好日子呢
参考资料：《印尼华侨史》、《红溪惨案