《银河补习班》片名中有银河，有补习班就揭示了电影中的小主人公马飞的一个关于宇宙和补习班的故事。而透过整个故事是向我们传递出父亲对于一个孩子的教育，一个父与子跨越时光守护爱与亲情的故事。
整个电影是站在马飞的角度进行倒叙式描述的。马皓文因大桥坍塌事故进了监狱错过了儿子七年的成长，没想到再次见到自己的父亲却是在校当众被主任强制退学的时候，在这里我们能看到一位父亲为了儿子，和主任打赌“自己的儿子一定能考进年级前十，并且离开学校的时候会是这个学校最出众的孩子”。这之后马皓文并没有让自己的儿子进行各种补习班的培训，马皓文向儿子郑重的指出“清华北大只是过程，不是目的”。
随后更是言传身教，带动儿子自主学习，学习课本中所没有的。例如：为什么写不出作文，是因为没有感受生活，追求“真”，感受到什么就写什么。这在最后与前十相差21分的时候有了转机，受到在校领导打出平均分22.5分，成功留校。除此之外，马飞喜欢看航天展，父亲就带他逃课去看，走了许多地方。这在我们生活中，许多父母认为这种行为都是不应该。但是，我想说的是，生活中的历练可能会是最好的成长。马飞和父亲马皓文在返回的途中不幸走散，同时又遇到了百年不遇的大雨，因种种原因马飞陷入了大水中，想要放弃，可是一位父亲对于儿子的爱，拿着喇叭对儿子说：“看看你周围有什么，动动你的脑子想想办法，你一定能出来”。于是奇迹就发生了，马飞自做木筏子得以自救。我们能看到正是马皓文的教育让马飞有独立思考的能力，才有了死里逃生的机会。
马飞成功成为学校最优秀的学生，同时被航空学校录取，成为一名航空员，并且取得进入太空的机会，可是这是又因为父亲当年的事故另有隐情，不想因父亲影响自己，让父亲可以放下过去，父亲很心酸说着自己的教育很失败，父子两个都心里很难过。在太空舱中因电路问题，马飞大胆尝试，最终修复电路，返回地球，激动的告诉父亲“你的教育没有失败”。故事到此结尾。
在生活中，我们的父母都是望子成龙，可是仅仅是应试教育，上各种补习班，应对从小到大的无数个考试，只是让孩子成为答题的机器，从未问问孩子自己的爱好，让孩子真真正正学会独立思考的能力，成为一个真正优秀的人。所以，这是一个让父母和孩子都应该好好观看和思考的影片。