红海军水面舰艇部队对战时的弹药再补给并不是很上心，这和苏联海军导弹种类复杂、普遍体型魁梧、不便海上补给有很大关系。所以水面舰艇部队并没有提出武器运输船的需求，反而是导弹核潜艇部队需要专用的武器运输船以吊装大型的弹道导弹和飞航反舰导弹。
首先研制的是323系列武器运输船，包括323、323A、323B三个型号，红海军将其称为导弹技术浮动基地，可以运输补给12到18枚的P-5、P-6、P-13、P-21等核潜艇用飞航式反舰导弹，后来也被用于运送其他类型的导弹，包括水面舰艇上使用的各型战术导弹。这些运输船满载排水量4100吨，采用功率4000马力的双轴柴油机，最大航速达到13节，航程2000海里，续航力15昼夜。该船还拥有2座双管57毫米舰炮和2座双管25毫米高平两用炮，后期换成了自动化的AK-725型57毫米舰炮。从1962年开始到1978年，红海军先后装备了7艘这种导弹运输船。
此外，红海军还装备有771B型和1505型导弹浮动装载船，可以运送6～8枚弹道导弹或8枚反舰导弹，主要用于锚地补给，满载排水量1495吨，航行速度5节，航程200海里，可以与导弹武器运输船配合使用。
1964年，为了给新型的弹道导弹核潜艇补给导弹，塞瓦斯托波尔的“珊瑚”中央设计局设计了1791型海上导弹运输船，该船能够携带16枚洲际弹道导弹或16枚大型的战术反舰导弹，船上的大型起重机带有随动装置，可以保证潜艇与运输船之间相互晃动的情况下为潜艇吊装导弹不受影响。船上安装有2门25毫米自动炮作为自卫武器，满载排水量4480吨，航速14节。首船“阿姆加河”号于1972年在高尔基市的红色索尔莫夫造船厂建成，一共建造了3艘，后2艘排水量增加到了5500吨，航速提高到了15.5节，航程达到3600海里。
为了给第三代导弹核潜艇补充洲际导弹，“珊瑚”设计局又在上世纪80年代设计了11570型导弹运输船。按照其设计，列宁格勒海军造船厂于1986年建造了一艘“亚历山大勃罗金”号武器运输船，满载排水量达到11440吨，拥有125吨、12吨和9吨起重机各一台，防御武器为4座AK-630近防系统和2座4联装的“箭”-3防空导弹系统。此外，同期还有一艘740型干货运输船被改装成了10680型武器运输船，命名为“伏明海军中将”号，满载排水量为3370吨。
实际上，苏联的武器运输船虽然也能够为水面舰艇补充反舰导弹等武器，但主要用途仍然是作为弹药的浮动仓库，用于在基地与锚泊点之间的导弹运输，并不具有远洋航行能力。