中科院上海生化与细胞所—化学生物学技术平台

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编 者 按

为更充分地实现原创性基础科研成果的价值和社会影响，促进转化研究的开展，早在2008年我们中科院上海生化与细胞所（SIBCB）就开始筹建化学生物学技术平台。本平台是作为公共技术服务平台，建设目标是为所内外各研究组在高通量药物筛选和全基因组功能基因筛选方面的研究需求提供服务。

本文由医麦客原创

撰文丨阿浪

责编丨刀刀

化学生物学技术平台

为更充分地实现原创性基础科研成果的价值和社会影响，促进转化研究的开展，早在2008年我们中科院上海生化与细胞所（SIBCB）就开始筹建化学生物学技术平台。本平台是作为公共技术服务平台，建设目标是为所内外各研究组在高通量药物筛选和全基因组功能基因筛选方面的研究需求提供服务。

主要任务

以高通量实验技术为手段，利用全基因组siRNA或cDNA/ORF等文库等进行功能基因组学研究，推动各研究组在生命科学各领域的创新性发现和研究，发掘新的潜在药物靶点，并在其基础上建立高通量筛选实验体系；同时利用中药等来源的天然活性小分子等化合物库，针对这些原创性新靶点进行活性小分子化合物的筛选和研发，为研发新的小分子探针或药物奠定基础。在利用高通量实验大规模快速推进基础研究的同时，还可将其与应用转化紧密连接起来，服务于为国家人口与健康重大需求，提供源头创新成果。

文库资源

截至目前，我们已通过国内和国际合作拥有七万余种不同类型的小分子化合物实体库，以及人类和小鼠的各约两万个基因的全基因组siRNA基因沉默文库或ORF过表达文库。

药物筛选方向

目前已可提供39个商业来源和15个合作来源的化合物库，共72601种化学小分子。其中包括约10000种中草药等天然产物来源小分子和约4000种国际上被批准可用于临床的小分子药物或候选药物。

商业来源的化合物库

可分为不同的激酶抑制剂库、磷酸酶抑制剂库、生物活性化合物库等等，涵盖抗肿瘤、GPCR、表观遗传学、激酶、抗感染及神经科学等研究领域，以及PI3K、Wnt、TGF-β、JAK等热门通路，生物活性信息丰富。商业来源中有多个上市药物库，所有化合物得到FDA、EMA、CFDA等权威部门审批或收录在USP、EP、BP、JP、CP等药典文献中，是老药新用、细胞诱导以及新的药物靶点筛选的有效工具，可涵盖多个研究领域，如肿瘤、心脑血管、炎症、免疫、神经系统、呼吸系统等等。

合作来源化合物库

主要是中药等天然产物分离所得单体化合物，合作方包括中科院昆明植物所、中科院上海药物所等等。我们还正在与国外专业药物研发机构合作共建转化研究平台，共享其独有的基于成药性设计的化合物库，合作开展小分子新药研发。同时，我们也已有专业的软件和人员，可以顺利开展化合物的构效分析、虚拟筛选、分子对接、药效团设计等计算机辅助分析。

我们已拥有多套自动化液体工作站、高内涵细胞显微成像分析系统、活细胞实时监测系统、自动化洗板机、自动化封/撕膜机等功能先进的专业高通量实验设备。已建立涉及炎症、肿瘤、心脑血管疾病、神经退行性疾病、糖尿病等不同疾病领域的多个高通量高内涵药筛系统，采用纯蛋白或细胞皆可，可进行Alphascreen、TR-FRET、Luciferase报告基因、酶活检测、吸收光、荧光强度、细胞数目和形态结构、细胞内荧光或免疫荧光等多种生化指标或细胞分析检测方式。

同时，我们也直接提供实验技术服务，有多年科研经验的多位博士作为专职技术主管负责不同技术领域：功能基因组筛选、高通量药物筛选、计算机辅助药物设计。

大规模筛选技术服务流程和耗时类似于独立科研课题，需要研究者和平台人员沟通讨论、设计方案、优化自动化实验条件、开展大规模高通量筛选、数据分析、Hits复筛，等等。

同时，建议研究组在确定筛选课题时，最好自行建设有配套的生化、细胞、动物等不同水平的生物学活性测定实验体系，以便对大规模筛选所得到的Hits能顺利进行系统深入的功能验证。

我们一直秉承公共平台提供科研服务的理念，在过去几年中本平台已经为国内数十个科研院校/企业单位的上百个研究组/部门提供过平台服务。随着平台软硬件设施的建设发展和技术团队的不断成长，非常欢迎更多的所内外生物医药领域科研人员来使用我们的科研服务资源。

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