邱会作将军，1914年4月15日出生于江西省兴国县高兴圩上密村。全家仅靠一点薄田维持生活。虽然家境贫穷，父亲仍然送他读了两年书。
1929年，邱会作与哥哥邱会佳一起参加了红军，被编入兴国县地方武装。1934年4月，邱会佳在广昌战役中牺牲，成为一名红军烈士。不久，邱会作又被编入红三军第九师二十五团，任通讯员、宣传员。每到驻地，邱会作和其他红军指战员一样进行宣传群众工作，经过锻炼，他向群众讲话干脆利落，生动活泼，道理深入浅出，并且用当地口言，受到欢迎。党组织发挥他的宣传才干，每到一地都让他担任宣传工作，写墙报、刷标语、编快板、演活报剧、唱歌。1930年11月，邱会作加入中国共产主义青年团。1931年7月，任红五军团宣传队队长。1932年4月转入中国共产党。
1932年秋，邱会作入瑞金工农红军学校第五期学习。期间，既学习理论和军事知识，并学习财务知识，展现出了计算和记数字的特长。因学习刻苦，训练成绩好，任模范班班长。1934年9月，邱会作任中央革命军事委员会供给部统计员，掌握着中央红军全部人员、兵力、枪支、马匹、军械、弹药、粮食等绝对机密，因此外出办事，都要特派警卫跟随。邱会作善于管理物品，经手物品的分配、保管，井井有条。不久，任总供给部机关党支部书记，总供给部政治指导员。
1935年10月第五次反“围剿”失败后，邱会作随中央红军参加长征。1935年任中革军委第四局三科科长。长征途中，仍负责做后勤工作。因失去根据地，每天行军的数万红军吃饭、穿衣、武器弹药都难以为继，邱会作千方百计想法解决。为解决鞋子问题，规定后勤人员负责收集打草鞋的草，分发给红军战士，教红军战士打草鞋。宿营后，战士睡觉前必须打两双草鞋，第二天早晨出发时，穿上一双，带上一双，路上鞋坏了，就换上另一双。为解决粮食问题，每到一地都要向当地老乡了解什么野菜、野果能吃，搞后勤的和战士一起挖野菜充饥。同时尽力征购粮食。长征时，邱会作把自己省下的盐巴送到卫生部公用，救了不少伤员。长征中，邱会作严格要求自己，不多吃一粒粮，不多占一分钱。分配物资也按规定办，不讲人情。途中,邱会作负了伤，组织准备留他在当地老乡家养病，但他坚持拖着病体跟部队走，实在走不动，就拿出自己积攒的津贴请老乡背他追赶部队，背一天给一块大洋，背了两天终于赶上了部队。
1936年7月，邱会作任红军总供给部粮秣处处长。
全民族抗日战争爆发后，邱会作任中央军委供给部副部长。1939年1月，任中共中央财政经济委员会委员、中共中央生产委员会委员。1940年，为加强豫皖苏边区财经工作力量，邱会作任豫皖苏边区财经委员会主任兼新四军第六支队供给部政委。1941年1月皖南事变后，任新四军第四师政治部组织部长。同年7月，任第四师供给部政委、供给部部长。1943年，奉命入中共中央党校学习。1945年4月至6月间，邱会作作为华东代表团成员，参加了党的七大。
抗日战争胜利后，邱会作任军调处北平执行部秘书人事组组长，热辽军区政治部主任。1946年12月，任中共晋察冀边区第二十二地委书记兼军分区政委。1947年8月，邱会作任刚组建的东北民主联军第八纵队副政委兼政治部主任、第八纵队党委常务委员。上任后，针对部队为东北籍新战士，没有接受过军事训练，武器装备不足，多数有恋家思想的实际，邱会作严抓军事训练，并且提出“保卫胜利果实””保卫土地改革成果”的口号，积极开展指战员的思想政治工作。9月上旬，第八纵队即投入战斗，与第九纵队一起，在锦西以西的杨家杖子歼灭敌军三个师大部，共1．5万多人。紧接着，第八纵队与第九纵队一起于9月底往北宁路锦检段展开大规模的破袭战，攻克敌据点十余个。10月，第八纵队与第七纵队、第九纵队一起，又向北宁路沿线积极出击，全歼敌暂编第五十师两个团，解放黑山县，攻克阜新。第八纵队还单独包围了义县，迫使华北援敌改变了方向。1948年1月，邱会作任东北野战军第八纵队副政委兼政治部主任，同年3月任第八纵队政委、党委书记。辽沈战役开始时，第八纵队为攻打锦州的五个纵队之一，率先攻入锦州城内，随后在解放沈阳战役也是最早攻入城中的部队。1948年11月，邱会作任东北野战军第四十五军政委、党委书记。1949年1月，第四十五军参加了平津战役攻克天津战斗。此役，全歼守敌13万人，天津警备司令陈长捷被俘。
1949年3月，东北野战军编为中国人民解放军第四野战军，邱会作任第四野战军四十五军政委，第十五兵团副政委兼政治部主任。参加了渡江战役、衡宝战役和广西剿匪。
1949年12月，邱会作任广西省人民政府委员会委员。1951年5月，任华南军区党委常委。同年12月，任华南军区政治部主任兼军法处处长。1952年8月，任中南军区政治部第二副主任。1954年10月，任解放军总后勤部副部长兼副政委。1955年3月，任总后方勤务部党委副书记。1955年8月，兼任后勤学院院长。同年10月，任后勤学院党委书记。1955年9月，任解放军党的监察委员会委员。同年11月，任总后方勤务部和总财务部党的监察委员会书记。1959年3月，邱会作入高等军事学院基本系第一期第二班学习兼班主任。同年10月，任为解放军总后勤部部长、总后勤部党委第一书记。1962年12月，兼国务院国防工业办公室副主任。1967年8月，任中央军委办事组成员。1968年9月，任解放军副总参谋长兼总后勤部部长、总参谋部党委副书记。1969年4月，在中国共产党第九次全国代表大会上，邱会作当选中央委员，在九届一中全会上当选中央政治局委员。同月被任命为中共中央军事委员会委员。
1955年，邱会作被授予中将军衔。荣获二级八一勋章、一级独立自由勋章、一级解放勋章。是中华人民共和国第三届国防委员会委员。
1971年9月“九一三”事件后，邱会作被隔离审查。1973年8月，中共中央决定开除邱会作的党籍，撤销其党内外一切职务。1981年1月25日，中华人民共和国最高人民法院特别法庭确认邱会作为林彪、江青反革命集团案主犯，判处其有期徒刑16年，剥夺政治权利5年。
1981年9月，邱会作被批准保外就医。保外就医期间，中央对他的生活给予了妥善安排。上世纪90年代初，组织上将他和夫人胡敏安置在西安市南郊的一个干部离休所居住。
2002年7月18日，邱会作在北京逝世，享年89岁。