毗卢寺始建于南朝，重建于明嘉靖年间（1522-1566年），因寺中供养毗卢遮那佛，初名毗卢庵。历史源远的毗卢寺也是饱经沧桑，几兴几衰。清咸丰年间毁于兵火。清光绪十年（1884年），曾国荃任两江总督，在原毗卢庵址建寺，建大雄宝殿、万佛楼和藏经楼等，将原毗卢庵旧址周边扩大，改毗卢庵为毗卢寺，毗卢寺乃“金光明道场”，为南京第一大寺。
主要建筑有山门、天王殿、大雄宝殿、观音殿、万佛楼、藏经楼、毗卢殿、塔院、法堂、斋堂等。
中华民国建都南京之时，因毗卢寺坐落在民国政治文化中心，而一跃成为全国佛教的中心，中国佛教会、中华佛学研究会、中国宗教联谊会、首都中医院皆设于此。
当时寺中有万佛楼一座，供奉镏金铜佛3000尊，造型各异，金碧辉煌。
民国要人多相往来，连孙中山先生也曾亲往静思。赵朴初先生长期在此工作，1947年还在毗卢寺召开全国佛教代表会议。
在上世纪六十年代，曾经庄严肃穆的毗卢寺遭遇了前所未有的浩劫。寺内所供奉的3000尊佛像，散失在岁月的长河中。而原本用于修行和供奉的房屋殿堂，也被用作工厂用地。
1988年，时任全国政协副主席、中国佛教会会长的赵朴初居士，故地重游重返毗卢寺，面对着断壁残垣，表露了恢复这座古老寺庙的坚定心愿。
经过多年的努力和筹备，终于在2004年，中国最大的汉传佛教仿明清单体古建——万佛楼在毗卢寺内复建完工。随后，2011年大雄宝殿的修缮也圆满竣工，复建的钟楼、禅堂也相继落成开放，寺庙再次恢复了往日的庄严与肃穆。
2015年10月，大雄宝殿前的放生池落成，双井注水，活水引流，源源不断，象征着生命的延续与佛法的传承。当清澈的泉水注入池中，泛起层层涟漪，仿佛在诉说着一段段关于信仰与坚守的传奇故事，法喜圆满，人心皆安。
斗拱飞檐间，“万佛宝楼”四字描金大字熠熠生辉。楼外琉璃飞檐层叠而上。
走进宝楼，内中更是雕梁画栋、珠灯藻井，金碧辉煌，恍若仙境，让人目不暇接，惊叹不已。那些形态各异的镏金铜佛，更是金光万道，与日争辉，仿佛有生命一般，静静地守护着这片净土，善男信女们虔诚地供养着这些佛像。
如今的毗卢寺，庄严而精致，香烟缭绕，给人一种宁静而神圣的感觉。院中，两株黄色的银杏树叶子已落满地，如同金黄色的地毯一般。
据说这两株银杏树是曾国荃当年亲手种植的，它们见证了岁月的流转，仿佛在诉说着百年的因果轮回。每年秋天，这两棵黄色银杏树与毗卢寺的红色建筑相映衬，形成了一幅绝美的画卷，吸引了无数年轻人前来拍照打卡，留下美好的回忆。
寺内的西方三圣殿往里边走，有一处禅茶斋面供应。虽然今天是个工作日生意显得有些冷清，但那份宁静与禅意却更加浓郁。
毗卢寺内有一个不大的毗卢寺史料博物馆，参观一下对了解毗卢寺历史很有帮助。
毗卢寺Tips：
地址：南京市汉府街4号
开放时间：9:00-16:30
门票：20元（含3支香）