HIV感染者接受抗逆转录病毒治疗对控制疾病进程，保证生活质量十分重要。长效抗逆转录病毒lenacapavir成为FDA批准的首个靶向HIV-1衣壳蛋白(CA或p24)的药物，使得针对HIV-1衣壳蛋白的药物开发备受关注。
本文中作者利用此前开发的热稳定性鉴定方法（TSA），对含有硫氟交换基团的小分子化合物库与CA的结合进行了鉴定。TSA利用CA不同折叠形式与疏水性染料的结合能力差异对衣壳蛋白的热稳定性进行鉴定。当CA因加热而部分解折叠时会增加其与疏水染料的结合能力，从而导致荧光信号显著上升。通过荧光信号的变化曲线可以确定其Tm值，从而表征蛋白的热稳定性。当小分子与CA结合后，则可能会带来蛋白热稳定性的变化，因此可以通过TSA来对小分子的CA结合能力进行表征。
利用该方法作者从472个小分子中筛选到了五个显著性改变CA热稳定性的小分子，并且对其进行了进一步表征。作者发现BBS-84、BBS-91和 BBS-103可以在较低浓度下抑制CA组装。并且BBS-84、BBS-91和 BBS-103具有显著的抗病毒活性，其中BBS-103具有最低的EC50。随后作者利用质谱鉴定到了BBS-103的共价结合位点，发现其修饰在了CA121的145号位酪氨酸上。随后通过docking确定了其结合口袋。作者随后还对BBS-103的抑制机制进行了研究发现，与此前经典的HIV共价抑制剂Ebselen不同，BBS-103并不会影响病毒的脱壳过程而是阻碍衣壳蛋白的组装。
综上，作者开发了一种基于热稳定性分析的HIV衣壳蛋白抑制剂的鉴定方法，鉴定到了含有SuFEx基团的可点击抑制探针。靶向HIV-1衣壳的化合物的共价结合可以帮助未来设计抗逆转录病毒药物或化学探针，这将有助于研究HIV-1的复制过程。
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2024.02.012
本文来源：褚贝贝课题组