许多抗癌药物通过靶向癌细胞内的DNA发挥作用，阻止其增殖。然而，癌细胞偶尔会发展出修复这些药物造成的损伤的机制，从而降低其有效性。因此，医生越来越多地接受一种称为精准医学的癌症治疗新方法。这种方法包括选择与个体癌症独特属性精确匹配的药物。事实证明，精准医疗对解决已经进化到逃避传统治疗的癌症特别有益。
Trabectedin，一种从海鞘中提取的有前途的药物
涡虫海鞘
，在对抗对传统治疗耐药的癌症方面显示出潜力。
然而，其确切的作用机制至今仍不清楚。
韩国基础科学研究所基因组完整性中心的SON Kook博士和Orlando d . sch RER教授与瑞士苏黎世联邦理工学院的Vakil TAKHAVEEV博士和Shana STURLA教授共同合作，揭示了这种神秘化合物的内部运作方式。
IBS研究人员使用高灵敏度的高通量彗星芯片检测细胞基因组中形成的断裂，发现trabectedin诱导癌细胞DNA的持续断裂。
研究人员表明，这些DNA断裂只在DNA修复水平高的细胞中形成，特别是那些运行一种称为转录偶联核苷酸切除修复（TC-NER）的途径的细胞。
TC-NER是一种重要的机制，可以识别转录过程中的DNA损伤，启动涉及两种内切核酸酶ERCC1-XPF和XPG的修复过程。
Trabectedin的DNA损伤破坏了这一过程，允许ERCC1-XPF的初始切口，但阻止了XPG的后续行动，停止了TC-NER过程。
这种修复过程的中断导致持久的DNA断裂，最终杀死癌细胞。
利用这一对DNA断裂如何积累的机制的新见解，研究人员试图确定这些断裂发生在基因组的哪个位置。
对trabectedin诱导的DNA断裂模式的分析表明，断裂在整个基因组中形成，但仅在转录活跃的位点形成，并随之发生TC-NER。
这导致了一种称为TRABI-Seq（用于trabectedin诱导的断裂测序）的新方法的开发，该方法可以精确识别肿瘤细胞DNA中TRABectedin的作用位点。
孙博士解释说:“ERCC1-XPF的切口在DNA中产生了一个明显的游离羟基，使我们能够对DNA进行测序并定位这些断裂。”
TRABI-Seq正在各种癌细胞上进行测试，以确定trabectedin在靶向具有高级DNA修复能力的肿瘤方面的功效，这些肿瘤通常与癌基因激活导致的转录水平升高有关。希望这些发现将有助于将trabectedin定位为识别脆弱癌症的预测标记物和精确治疗的治疗选择。凭借其靶向对常规疗法耐药的肿瘤的能力，trabectedin可能为具有高活性DNA修复能力的耐药癌症的斗争带来进一步的希望。