中科院持有联想集团及联想控股的股权比例变化大致分为五个阶段。
【第一阶段】
时间点：从1984年创立至1992年。
中科院持股比例：联想控股为100%，联想集团为33.33%。
1：联想母公司创立之初：中科院100%持有
据联想控股招股书显示，1984年11月，由中国科学院计算技术研究所投资20万元，设立了中国科学院计算技术研究所新技术发展公司（下称计算所公司），计算所公司即联想前身。该公司于1991年4月更名为北京联想计算器新技术发展公司（下称“北京联想发展”），1998年8月，又更名为联想集团控股公司（下称“联想控股”）。
直至2001年改制前，该公司均为一家全民所有制企业，可视为中科院100%持有。
2、香港联想创立之初：中科院持股33.33%
据联想控股招股书显示，1988年4月，计算所公司、中国技术转让（香港）有限公司（下称“技转公司”）与香港导远电脑系统有限公司（下称“导远公司”，已于2002年8月解散）三方共同出资组建了香港联想集团有限公司（下称“香港联想”）。香港联想即后来成功在港交所上市的联想集团，该公司设立之初，原始股本为90万港元，其中计算所公司投入30万、技转公司投入30万、导远公司投入30万，按此计算，两家国企共持股约66.67%，其中中科院通过计算所公司持股33.33%。
据联想集团招股书披露的信息显示，1993年11月9日，公司中文名称变更为香港联想控股有限公司。
3，香港联想增资后：不详
据1994年1月25日公开发行的香港联想上市招股书记载。1992年10月15日北京联想发展投入9890万港元（约1270万美元），导远公司投入10万港元进行增资扩股。增资后的具体股权占比数据不详，但不久后香港联想即于港交所上市，因此此次增资后股权占比应与上市后相差不大。另据招股书披露，上市后，北京联想发展获得2.618亿股，导远公司获得2.08亿股。至于只投入10万港元为何能得到2.08亿股，招股书上没有披露详情。
【第二阶段】
时间点：1994年联想集团上市后
中科院持股比例：联想控股为100%，联想集团约为38.78%
1994年2月14日，香港联想在港交所上市。
招股书和年度财务报告披露的数据显示：香港联想总共发行的6.75亿股中，上市后原三家股东共持股4.848亿股，其中北京联想发展持有2.618亿股，导远公司持有2.08亿股，技转公司持有0.15亿股。这也就意味着，香港联想上市后，北京联想发展持股占比为38.78%，导远公司持股占比为30.81%，技转公司持股占比2.22%。
北京联想发展为中科院100%持有，因此，至此时，中科院持有香港联想的股份比例即为北京联想发展的持股比例，为38.78%。
与此前相比，在不考虑饱受诟病的“港商负债持股”情况下，由于增资扩股，中科院持有香港联想的股权比例有所增加，从33.33%增至38.78%。
1998年1月5日，香港联想更名为联想集团有限公司（下称“联想集团”）并沿用至今。
自香港联想上市后直到2001年联想控股改制前，中科院持有联想控股和联想集团的股权比例基本维持未变。
期间值得一提的是，由于在香港的联想集团上市后业务急剧萎缩，业绩出现巨额亏损，1997年，北京联想发展的核心业务被“整合”进了联想集团，也就是将中科院100%持股的北京联想发展最赚钱、最优质的核心资产注入了濒临崩溃的联想集团，这也一度使得在香港上市的联想集团股价暴涨。
【第三阶段】
时间点：2001年联想控股改制后
中科院持股比例：联想控股降至65%，联想集团降至25%
据《联想风云》一书记录，1998年，计算所公司改制，千余人缩减到百人，大部分人并入联想集团。联想员工持股会（640人参与）成立，并在这一年获得了35%的分红权，可以分享企业经营的净利润。中科院获得65%的分红权，联想自身获得剩余的35%。
联想员工持股会后被北京联持志远管理咨询有限公司（下称“联持志远”）吸收合并。据《每日经济新闻》报道，2011年6月1日，联想职工持股会将所持的联想集团股票全部转手给联持志远。至此，联持志远正式接收联想职工持股会35%的股权，成为排在中国科学院国有资产经营有限责任公司之后的第二大股东。联持志远的法人代表为北京联持志同管理咨询有限责任公司（下称“联持志同”），而联持志远合伙协议显示，作为联持志远普通合伙人的联持志同担任合伙企业的执行事务合伙人，这也意味着，以柳传志为法定代表人的联持志同拥有全权负责联持志远投资业务以及其他合伙事务之管理、运营、控制、决策的全部职权。
2001年，联想顺应潮流进行改制，从全民所有制企业改成有限责任公司。据联想控股招股书显示，改制后，其注册总资本为66086万元，其中中科院出资42955.93万元，占股65%，是绝对的控股股东；另外联想控股员工持股会出资23130.11万元，持有35%的股份。随后，联想集团控股公司更名为联想控股有限公司。
此时，中科院持有联想控股的比例降至65%，由于联想控股持有约39%的联想集团，这也意味着，中科院对联想集团的间接持股比例降至了约25%。
【第四阶段】
时间点：2009年中科院转让股权后
中科院持股比例：联想控股降至36%，联想集团降至约12%
2009年，中科院把联想控股29%的股权以27.55亿元转给了泛海控股集团有限公司（下称“中国泛海”）。
公开资料显示，2009年8月7日，中科院将其所拥有的联想控股29%股权在北京产权交易所挂牌转让，挂牌价格27.55亿元。同年9月8日，作为挂牌期间产生的唯一一家符合条件的受让方，中国泛海成为联想控股的第三大股东，交易价格为27.55亿元人民币。 据华夏时报报道，对于中国泛海成为29%股权受让方，联想控股总裁柳传志没有对外正式回应，其只是强调，联想控股希望未来的投资方有金融背景，能够给联想提供更多的资金。
针对舆论对此次交易的质疑，2021年12月10日，联想控股公开回应称，2009年转让联想控股股权，未造成国有资产流失，经专业机构认定，联想控股归属于母公司所有者权益账面值为77.2亿元，评估值为92.6亿元。本次交易联想控股归属于母公司所有者权益溢价至95亿元，对应的29%股权交易价格为27.55亿元。
联想控股官网显示，2009年，联想控股成功引入新股东中国泛海，股权结构由原来的中国科学院国科控股65%、联想控股职工持股会35%，演变为中国科学院国科控股36%、联想控股职工持股会35%、中国泛海29%。这也意味着，中科院对联想集团的间接持股比例降至了约14%。
另据证券时报报道，2012年，中国泛海持有的29%股权比例已悄然变为20%，联想控股员工和管理层的持股从最初的35%增长到42.5%。也就是说，中国泛海让渡了9%股权给联想员工和高管团队。
此外，联想集团公告显示，2011年6月17日，联想集团行政总裁杨元庆从联想控股手里购得联想集团8%的股份，共计7.97亿股，花费约为31.5亿港元。杨元庆在声明中表示，这次交易属于其个人投资行为，作出这个决定是基于对公司充满信心。联想官方网站公布数据显示，截至2010年11月19日联想集团的股权结构为：公众持股56.93%、联想控股持股42.35%、董事持股0.72%。杨元庆此次增持后，联想控股持股降为34.82%，杨元庆持股为8.7%，剩余为公众及其他董事持股（56·48%）。这也意味着，中科院间接持有的联想集团股份降至了约12%。
【第五阶段】
时间点：2015年6月联想控股上市后
中科院持股比例：联想控股降至29.1%，联想集团降至9%
2015年6月，联想控股也在香港上市，上市之后，众多股东股权都出现了不同稀释。国资公司资料显示，发行完成后，中科院国科控股持股比例下降为29.1%，联想控股创业员工持股20.4%，泛海控股持股17%，核心管理团队持股8.17%，骨干员工及其他人员持股8.83%，社保基金将持股1.5%，还有15%股份向其他H股股东出售。
联想集团方面，据联想集团申请科创板上市时披露的招股书显示，截至2021年3月31日，联想控股直接持有联想集团23.81%的股份，另外还间接通过全资公司南明有限公司和众杰有限合伙持有联想集团7.22%的股份，相当于联想控股合计持有联想集团31.03%的股份。这也就意味着，此时，中科院间接持有联想集团股份的比例降至了约9%。
至此，从成立至今，从持股比例角度来看，中科院持有联想控股的股权比例一路从100%降至失去了控股权的29.1%，而对承载了联想核心业务的联想集团，持股比例则从33%降至了约9%。