在刘备向孙权借得了南郡之后，就准备以南郡作为跳板，夺取益州。他为了实现“跨有荆益”的目标，就一方面以各种理由打消孙权夺取益州的念头，而自己则以张松为内应，发动了夺取益州的战役。在这场战役中，刘备在初期只带领了一部分兵力，将主力放在荆州防守自己的根据地。
可是，出乎刘备意料之外的是，被他和诸葛亮评价为“闇弱”的刘璋，却对他进行了殊死的抵抗。在与刘璋军队在战斗中，刘备的军师庞统也在战场上阵亡了。在这种情况下，刘备只得将荆州的主力调入益州增援。这支军队的领头的将领是诸葛亮、张飞和赵云。那么，这支军队的主将究竟是谁呢？
一、主将为诸葛亮说。
在我们的印象里，这支军队的主将应该是诸葛亮。因为《三国演义》的影响，我们都认为，诸葛亮是刘备的军师，带兵打仗当然是诸葛亮的责任。但是，如果我们知道，诸葛亮担任的军师中郎将这个职位，只管理军队的日常管理工作，并不插手行军作战的话，就知道我们受到的误导了。
诸葛亮在军队中，最主要的工作是军队的日常管理和建设，他在训练军队方面很有专长。在历史上对诸葛亮评价说他“治戎为长”是一点都不夸张的。诸葛亮训练的军队，号令严明，军容整齐，确实是第一流的军队。但是，在指挥作战方面，诸葛亮就稍逊一筹了。这是因为刘备在世的时候，在军事行动上主要由自己和手下大将负责，很少让诸葛亮上阵。
在张飞被害之前，诸葛亮是没有军权的。当时蜀汉的司隶校尉是由张飞担任的，在张飞死后，诸葛亮才担任了司隶校尉一职，开始管理军队。在夷陵之战后，刘备让诸葛亮在成都南北郊开设军营，训练军队。这支军队成为了蜀汉后期军队的基础，诸葛亮也因此开始掌握了军权。不过，即便如此，刘备在托孤的时候，依然将军事交给李严负责。
因此，在荆州军队入川的时候，诸葛亮依然还是文官的角色。而且我们也没有看到诸葛亮具体指挥作战的记载。我们从这些迹象可以看出，当时的诸葛亮并不是这支军队的主将。
那么，诸葛亮不是这支军队的主将，他随军入川又扮演了什么角色呢？诸葛亮入川的主要目标有两个，一是率领部下配合张飞作战，二是率领荆州的文官团体接收占领的城池，迅速建立刘备的统治。以诸葛亮的身份、职责来看，第二个目标才是他的重点目标。
二、主将为赵云说。
主将是赵云这个答案估计没有人会认同。这是因为赵云的身份和资历，都不可能担任这支数万大军的主将。赵云在加入刘备的阵营后，就一直被刘备用作自己的内卫首领。他对刘备忠心耿耿，多次救刘备于危难之中。尤其是在长坂坡一战中，赵云从曹军的重围中救出了刘备的家眷，为刘备保住了幼主刘禅。
在刘备占据荆州后，赵云担任过桂阳太守，变成了文官。在刘备和孙权的妹妹结婚后，孙夫人和她的那批随从，平日里飞扬跋扈。刘备对此十分不满。他认为赵云为人威严稳重，一定能够镇压住那些东吴的人员。所以，赵云又被刘备调回，掌管刘备的府内之事。
在孙夫人回东吴的时候，想要把幼主刘禅带回东吴。幸亏赵云闻讯及时赶到，才将刘禅夺回，粉碎了东吴的图谋。当然，自从孙夫人回东吴后，也没有再回到荆州。赵云也暂时没有了任务，这一次他也随同大军一起入川，听从刘备的指挥。
我们可以看到，赵云论文官的职位，他从属于诸葛亮之下。论武将的职位，他又比不上张飞。因此，他在这支军队中，不会是主将。那么，赵云在这支军队中的角色是什么呢？他的角色是作为诸葛亮的助手，听从诸葛亮的指挥，保护诸葛亮等军政人员。
我们看《赵云传》中就明确的说，“亮率云与张飞等俱溯江西上”。赵云在荆州时担任桂阳太守，他的上司就是诸葛亮。在掌管内务的时候，他的直属上司又是诸葛亮。因此，在这次入川的行动中，赵云是作为诸葛亮的直属部下参战的。
在夺取江州后，赵云单独率军从外水上江阳，取犍为，与诸葛亮会师成都。这也是赵云难得的独自率军，取得成功的战例。
三、主将为张飞说。
其实，我们看了上面的分析，就已经明了这支军队的真正的主将就是张飞。其实，这个原因很简单，张飞在刘备阵营中，是仅次于关羽的名将。在后世的武庙七十二名将中，张飞赫然在内。刘备对于军事行动十分谨慎，自然只会把大军交给作战经验丰富的张飞指挥，而不是当时相对经验较差的诸葛亮。
在《三国志》中的很多地方对张飞在这次行动中的身份都有所表露。比如说在《法正传》中，法正给刘璋的劝降书中，就说到“今张益德数万之众，已定巴东，入犍为界，分平资中、德阳，三邈道侵，将何以御之？”在这里，法正就明确的说明，入川的数万荆州援军的主将是张飞。
再比如说在江州破严颜的时候，就只见到张飞的表现，而没有诸葛亮的记述。在入川的人员中，《宗预传》中就记载“建安中，随张飞入蜀”。可见当时入川的荆州主将是张飞。而在《张裔传》中，也可以看到，“张飞自荆州由垫江入，璋授裔兵，拒张飞於德阳陌下，军败，还成都。”当时刘璋派兵阻挡的主要敌人还是张飞。
那么，让我们认为诸葛亮是这次入川军队主将的话，还是上面我们引用的《赵云传》的那句话，“亮率云与张飞等俱溯江西上”。这句话其实是古人断句的问题。我们对这句话可以断句为亮率（云与张飞），也可以断句为（亮率云）与张飞。我们从上面的分析来看，后一种断句更为合理一些。
正是因为张飞在入川之战中战功卓著，所以在刘备占领益州后进行封赏时，张飞所得的封赏和诸葛亮、关羽、法正四人一样，都是最高的奖赏。史书记载为：“益州既平，赐诸葛亮、法正、飞及关羽金各五百斤，银千斤，钱五千万，锦千匹。”如果张飞的功劳是在诸葛亮的指挥下取得的，这样的封赏就难以说过去了。从这里我们也能看出，张飞不可能是诸葛亮的部下。
结语：
我们从上面的分析，就能够搞清楚这支入川军队的组成了。其实造成大家认知混乱的原因，是这支军队的作用和个人的分工杂乱。其实，这支入川的军队，肩负着两个职责，一个是增援刘备，攻打刘璋。一个则是接收占领区，迅速建立刘备的统治。
前一个职责主要是军事任务，当然是由张飞负责。而后一个职责则是行政任务，是由诸葛亮负责。为了保证诸葛亮这些文官的安全，还给诸葛亮增加了一位副手，那就是赵云。所以，在《赵云传》中才会说到，诸葛亮是率领赵云和张飞一起入川的。
因此，在这支入川的援军中，指挥作战的主将当然是张飞。所以在《张飞传》中才会说道，“先主入益州，还攻刘璋，飞与诸葛亮等溯流而上，分定郡县。”在这里，张飞率领的军队作为主力，攻坚克难。而诸葛亮与赵云的军队则在后面接手管理。在到达江州后，由于对方已经是强弩之末，这支军队又进行了分兵，赵云也得到了单独领兵的机会，拿下了江阳和犍为。不过，在法正的劝降书中，把这些战果都归给了张飞。所以，这支入川军队的主将只能是张飞。