古代互市画面
纵观整个明朝，与蒙古之间一直是打打停停、纠缠不清，在花费了太多精力、财力之后，仍然无法确保北部边疆稳定。而反观清朝，却通过联姻拉拢的方式，与蒙古各部保持了较好的关系，除了平定准噶尔之外，双方始终未发生大规模的战争。那么，明朝为何不通过联姻的方式，与蒙古搞好关系呢？
原因之一：明朝与蒙古天然敌对，清朝则不存在这个问题
元朝乃是蒙古建立的国家，而明朝则是推翻元朝后建立的王朝，这导致双方从一开始便形成了敌对关系，而这种关系至少在明朝初期的一百年内是不会发生任何改变的。而清朝作为崛起于东北的民族，不论从生活习俗，还是从战略态势来讲，关系并不紧张。
从明朝和蒙古的博弈来看，明朝前期主要以打击为主，中后期则以战略防御和平衡牵制为主。从明太祖朱元璋到明成祖朱棣，明朝多次出兵北伐北元，从而彻底瓦解了北元残余势力，一定程度确保了北部边疆稳定。而自仁宣年间开始战略收缩后，明朝则主要依靠九边重镇进行战略防御，同时通过“贡市”贸易平衡牵制蒙古各部。
清朝则有所不同，清朝由于崛起较晚，初期实力相对较弱，为了寻求入关的机会，同样也为了确保侧翼和后方的安全，在没有绝对利益冲突的情况下，清朝（后金）自然不必与蒙古轻启战端。更何况，清朝崛起时蒙古已经是四分五裂，可汗对于蒙古各部统治力有限，因此清朝主要采取的便是通过联姻拉拢蒙古部落，并对可汗势力进行打击的策略。
根源上的敌视和友好，再加上明朝和清朝不同的民族政策，以及蒙古诸部的现实情况，这是造成明朝和蒙古天然敌视，而清朝和蒙古则天然友好的主要原因。同时，由于库图克图汗之子最终投降，黄金家族彻底失去了对草原的统治，再加上清朝的盟旗制度，蒙古各部再也无力恢复往日荣光。
原因之二：国力强弱不同，明朝没有必要采取和亲政策
正所谓“经济基础决定上层建筑”，国力强弱的不同，同样会影响到国家的对外政策，明朝由于国力一直较为强盛，因此并没有与蒙古和亲的必要，而清朝则恰恰相反。
虽说明朝在与蒙古的战争中，也曾遭遇过“土木堡之变”这样的惨败，但不可否认的是，明朝在国力方面，始终要远超蒙古。蒙古各部虽然时常南侵掠边，但除了“庚戌之变”等少数几次之外，却始终难以深入明朝腹地，而明朝却可以通过外贸一定程度掌控蒙古各部的经济命脉，再加上所谓的“天朝上国”心里作祟，明朝很难升起与蒙古各部和亲的心思。
清朝则不同，后金虽然在“萨尔浒之战”后已经逐步在辽东站稳脚跟，但刚刚崛起的后金实际上仍比较弱小，明朝依靠松锦防线仍然对后金保持着一定的战略威慑力，再加上朝鲜和蒙古此时依旧比较偏向明朝，后金不论是为了崛起，还是为了将来攻入关内，解决蒙古和朝鲜保证侧翼安全，都是重中之重，因此通过联姻分化瓦解蒙古部落，自然不失为一条妙计。
正是由于明朝和清朝国力方面的差距，使得明朝和清朝对待蒙古的态度截然不同。事实上，即使在“萨尔浒之战”战败，而蒙古部落中亲近明朝的内喀尔喀和叶赫部又先后被击败的情况下，明朝拉拢林丹汗的方式仍然是通过赏赐银钱来促使蒙古出兵，而并非所谓的联姻。
原因之三：明朝时期蒙古仍有退路，清朝时期蒙古退无可退
这一点则关系到了蒙古各部对明清两朝不同的态度，自古以来中原王朝始终对游牧民族无可奈何，一个主要原因便是其强大的机动能力，即使他们不敌中原王朝，也可退往漠北甚至更北方，等到恢复实力后再度南下。
明朝时期，虽然朱元璋时期明军通过北伐击溃了元朝残余势力，从而导致蒙古分裂，明成祖朱棣更是先后五次北伐，然而除了第一次和第二次取得一定战果外，其余三次北伐均难以找到鞑靼主力，反而给瓦剌崛起提供了时机，而在瓦剌衰弱之后，鞑靼便又迅速卷土重来。
而到了清朝，随着俄罗斯在西伯利亚的疯狂扩张，蒙古各部再也不能随心所欲的向北发展，退路已经完全被断绝。而在准噶尔部崛起后，又和沙俄沆瀣一气，又从西北部对蒙古各部造成了压力。北部和西北部的变化，导致蒙古各部只能选择归顺更加友好的清朝，因此蒙古各部也需要通过联姻，来加强与清朝之间的关系。
在明朝时期，蒙古的北方还没有出现俄罗斯这样的巨大威胁，他们的主要威胁仍然来自于南部的明朝，一旦不敌明廷，他们完全可以向北撤退，一直撤到明朝根本无法、无力打击为止。而自从俄罗斯东扩之后，被夹在中间的蒙古各部面对压力只能选择投靠更加友好的清廷。