一、工藤新一&毛利兰
作为《名侦探柯南》漫画中的男主角和女主角，工藤新一与毛利兰这段看似短暂却无形贯穿了整个故事的感情线必须首当其冲。
接下来要说的是——毛利兰与工藤新一的感情线。
从一开始，青梅竹马四个字就涵盖了一切，似乎这样的开端冥冥之中就已经注定了结局。相识、相知、相恋、相爱，这是理所应当的节奏。可惜作者并没打算按照大家的期望去创造故事，塑造角色。
第一集，除了片头对男主角高中生侦探工藤新一的介绍以外，重点全部放在一场平常到无亮点无槽点的约会，然而谁也无法想到，突然发生的案件和两个完全与案件无关的黑衣人（琴酒、伏特加）会就此打乱原本平缓的节奏。
就是这样一个小小转折点，使得两小无猜的工藤新一与毛利兰之间永远隔着一个说不出口的秘密。
随着后面故事一点点展开，大家越来越心疼毛利兰，心疼她的这份爱。日复一日的等待，一次次空欢喜，只因为对方是工藤新一，是她在小时候就发自内心喜欢着的人。
二、江户川柯南&灰原哀
与女主角毛利兰相比，灰原哀（本名宫野志保）的人物设定就复杂多了。她不仅仅是黑衣组织成员雪莉（Sherry），更是能让身体变小药物——APTX4869的发明者。以姐姐宫野明美遭到组织杀害为契机，反抗组织，吃下药物逃离组织。
做一个简单的比喻：如果说毛利兰是清澈透明的独唱，那灰原哀就可以说是不同声部在高低起伏中创造的小合唱。
正是因有无法自主选择的背景，成就了独一无二的灰原哀。
纵观《名侦探柯南》所有故事，无论是刚刚破千的TV版还是后来几乎一年一出的剧场版，灰原哀似乎从没有正面回答过感情问题，与江户川柯南（工藤新一）之间的关系也始终是徘徊在对手、战友与知音之间。
细节方面，除了日常总是用双关语来讽刺柯南、担心柯南的莽撞会引来黑衣组织的追杀和偶尔的淡淡笑容以外，恐怕再也拿不出像样的证据来证明灰原哀的心意。
但是，在剧场版《业火的向日葵》中，首次通过配角侧面引出这一设定，等于是间接证明了这条感性线的真实性，尽管灰原哀仍旧没有直接说出答案。