前言：宇宙中先有了地球后有了人类，然后才有了科学。假若存在上帝，科学一定是上帝的，但上帝未必科学！
科学是人类智慧的象征，它推动了社会的发展，改变了世界。
科学定义：科学是对已知世界通过大众可理解的数据计算、文字解释、语言说明、形象展示的一种总结、归纳和认证。
科学认为宇宙是客观存在的物质世界，它从自然中诞生依照物理规律运行。科学不反对唯心主义，否定了“上帝”的存在。
我们假设宇宙是上帝创造的，那么我们可以论证宇宙规律（一切的科学定律）都是上帝的杰作。
悖论一：科学的终点是上帝？
假若是上帝创造了宇宙及所有自然定律，那么科学的终点必然是上帝。如果上帝不想被人类看见，它就会不断的创造新规律。因此，科学家永远得不到终极科学理论，科学探索的道路没有尽头。如果科学探索没有尽头，人类永远无法证明“上帝”的存在。
结论：若科学探索没有尽头（而科学认为自然规律是稳定不变的，科学家可以得到终极理论，科学探索有终点），则间接证明了上帝的存在。
悖论二：在时间上科学存在“奇点”？
如果上帝不愿人类看到它的存在，随人类科技水平的进步，它会不断的创造新规律。在人类科学史上就会出现多个“奇点”。比如，每隔一段时期（300年或500年），科学史上会出现一次突破性的发现（被发现的新规律与旧规律之间有着明显的不衔接、不融洽，它是后来上帝为了隐藏自己创造出的新规律）。如果科学结论是连贯、融洽的，那么科学家一定能够得到终极理论。如果科学（自然规律）随时间总是存在突破性新发现，那么就证明了是上帝在不断更新、制造新规律。
结论：若科学史上科学定律在人类对自然探索过程中出现明显的断痕（科学定律在不同时期存在巨大差异），则间接证明了上帝的存在。
现实证据一：从牛顿经典力学到爱因斯坦相对论再到近代量子理论，物理学发生了翻天覆地的变化，自然奥秘深不可测，科学探索仿佛无穷尽。科学现象间接证明了上帝的存在。
悖论三：科学自身的科学性。
假若是上帝创造了自然规律，那么上帝一定掌握超越自然科学的能力。因此，如果自然中频繁发生科学无法解释的现象，则证明上帝的存在。如果科学能够解释自然中的一切现象（包括漫长的未来时代），那么一定存在可以解释一切的终极理论。
结论：在无限时间里，若科学不能解释自然中的一切现象，则能证明上帝的存在。
悖论四：宇宙的真相。
假若是上帝创造了宇宙，那么科学及其结论便是上帝制造的假象。如果人类执迷于科学就看不到宇宙真相，人类就不会听从上帝的旨意（科学否定了上帝的存在）。反之，假若人类放弃科学就得不到快速的发展，人类社会就处于低下等级。因此，科学的存在只能是人类史上的一段阶段但不会是永远。如果科学长久存在，则人类永远不会听从上帝旨意，这违背了上帝的本愿。如果没有科学，人类社会不可能快速发展，这也违背了上帝怜爱世人的初衷。故而，若存在上帝，则科学只能是人类史上的一个发展阶段。
结论：若科学只是人类史上的一个发展时期（未来科学被其它所取代），则证明了上帝的存在。
现实证据二：人类历史从悠久的神话文明发展到宗教文明，最后出现了科学文明。科学只是文明史上的一个阶段，科学也无法解释宇宙的一切现象。历史过程和科学现状间接证明了上帝的存在。