LncRNA已被鉴定为利用各种途径通过不同靶标调节抗病毒先天应答。核中是否存在丰富且高度保守的lncRNA，通过新机制调节抗病毒先天信号转导，不是很清楚。
2020年9月9日，医学科学院北京协和医学院曹雪涛及姜明红共同通讯在PNAS在线发表题为“LncRNA Malat1 inhibition of TDP43 cleavage suppresses IRF3-initiated antiviral innate immunity”的研究论文，该研究在功能上筛选巨噬细胞中不同表达的lncRNA，并确定富含核的lncRNA Malat1作为抗病毒I型IFN产生的负调节剂。该研究发现Malat1可以结合TDP43，抑制TDP43裂解为其活性形式TDP35，然后降低静息细胞中的核IRF3水平，维持免疫稳态。
病毒感染后，Malat1表达下调并通过切割成其活性形式TDP35释放TDP43以使其激活，然后TDP35阻止IRF3蛋白酶体降解，从而促进IRF3引发的抗病毒I型IFN的产生，从而使宿主免于病毒感染。有趣的是，已证实患有系统性红斑狼疮（SLE）I型干扰素病的患者外周血单个核细胞（PBMC）的MALAT1降低，IRF3升高。因此，该研究发现为控制病毒感染和IFN-I相关的炎性自身免疫疾病提供了潜在的靶标。
另外，2020年6月20日，曹雪涛团队在Immunological Reviews 在线发表题为“Nuclear innate sensors for nucleic acids in immunity and inflammation”的综述文章，该综述总结了鉴定核酸天然先天性感应蛋白（如hnRNPA2B1，IFI16，SAFA）及其在宿主防御和炎症反应中的作用的最新发现。
2020年4月9日，南开大学/中国医学科学院曹雪涛在Nature Reviews Immunology（IF=44） 在线发表题为“COVID-19: immunopathology and its implications for therapy”的观点文章，该文章系统总结了SARS-CoV-2产生的免疫学反应及潜在的治疗方法，这对于进一步认清SARS-CoV-2的致病机制提供了很好的参考作用，同时对于更好的控制COVID-19指引了方向。
作为抵抗病毒感染的第一道防线，I型干扰素（IFN-I）（IFN-α和IFN-β）的产生通过激活数百种IFN刺激基因（ISG）的表达而发挥了核心作用。建立“抗病毒状态”以限制病毒在感染细胞内的复制。干扰素产生不足会导致慢性病毒感染，而过量的干扰素产生也对宿主有害，从而导致自身免疫炎症和I型干扰素病。因此，至关重要的是在时间和空间维度上精确调节IFN的产生，以确保诱导出针对病毒感染的有效抗病毒先天应答，同时避免自身免疫性疾病的发生。
转录因子IFN调节因子3（IRF3）对于IFN的产生至关重要，并指导抗病毒免疫反应中多种基因的表达。IRF3的激活涉及病毒感染诱导的C末端几个位点的磷酸化，IRF3二聚化和易位至细胞核。然而，如何严格调控IRF3启动先天基因表达的活性尚待充分理解。
长的非编码RNA（lncRNA）参与许多生物过程，包括免疫和炎症。它们通过不同的机制参与宿主与病毒之间的战斗，包括调节RNA结合蛋白（RBP）的活性以及RNA代谢，尤其是宿主mRNA的翻译和降解。许多病毒通过病毒编码的核酸内切酶诱导广泛的宿主RNA decay，以减少免疫反应的激活，并提供宿主资源进行病毒复制的途径。
据估计，这些病毒内切核酸酶在表达后会降解多达三分之二的总mRNA。lncRNA的很大一部分位于细胞核中，核lncRNA通过不同的机制在生理，生物学和病理过程中发挥重要作用。然而，核丰富的lncRNA在抗病毒先天免疫反应中调节RNA代谢和RBP活性中的作用仍有待进一步研究。
在这项研究中，在功能上筛选巨噬细胞中不同表达的lncRNA，并确定富含核的lncRNA Malat1作为抗病毒I型IFN产生的负调节剂。该研究发现Malat1可以结合TDP43，抑制TDP43裂解为其活性形式TDP35，然后降低静息细胞中的核IRF3水平，维持免疫稳态。
病毒感染后，Malat1表达下调并通过切割成其活性形式TDP35释放TDP43以使其激活，然后TDP35阻止IRF3蛋白酶体降解，从而促进IRF3引发的抗病毒I型IFN的产生，从而使宿主免于病毒感染。有趣的是，已证实患有系统性红斑狼疮（SLE）I型干扰素病的患者外周血单个核细胞（PBMC）的MALAT1降低，IRF3升高。因此，该研究发现为控制病毒感染和IFN-I相关的炎性自身免疫疾病提供了潜在的靶标。
参考消息：
https://www.pnas.org/content/early/2020/09/08/2003932117