据外国媒体报道称，日本国内的新冠疫情最近又出现了第二次大反弹。在前几日单日的新增量都已经突破1500例。更让人担忧的是，根据研究所的新发现，日本国内自6月以来已经出现了大量的变异新冠病毒，且已经全面扩散。
日本国内新闻媒体称，这种新型变异病毒来源尚不知道，但可以知道的是日本第一波新冠病毒毒株是从欧洲传播过来的，且在五月底已经基本控制；但没想到的是，6月份国内莫名其妙出现了第二波疫情爆发，国内专家不理解，在进行了更为严格的控制后，为什么新冠病毒不但没有平息，反而暴涨起来。
直到最近日本的研究所才开始对这些新冠患者重新进行采样调查。东京、京都和国立感染症研究所在比对完新采集的病例后惊讶地发现，世界现存在毒株数据和日本新的病人毒株数据很多方面对不上。国立研究所的一名研究人员表示，变化程度已经大到了和原病毒有明显差别的地步，且这些特殊的感染者不是集中发现，而是分布在日本国内的各个地方。
但对于日本变异新冠的特性，这些人称后果还未确切知道。只了解变异病毒“可能更易感染难以控制”。当前国外专家关心的是，变异体会不会或者有无病重率、致死率高等特性，要求日本国内提供数据；日本研究所则称，因为发现的比较晚，暂时还没有收集数据进行分析，下一步会把研究结果向国际公开。
日本国立感染症研究所病原体基因组解析研究中心主任黑田诚否认了国外对日本变异病毒疫情恐慌的报道，他表示现在最新研究表明新病毒比原来的个体发生了6个碱基变异，这只是比其他的变异体多了一点点；况且现在国内存在病毒数量远远没有报道那么夸张，这些扩散也是从6月下旬才开始的。
分析称，目前疫苗研究已经到了关键时刻，最怕的是出现新型免疫疫苗的变异体。在4月份发现的刺突蛋白变异病毒，只有少数几个碱基出现了不一样的变化。但日本变异体碱基变化已经出现了6个，这就意味着不确定因素又会进一步增加，疫苗难起效果的概率继续变大。还有人称，疫苗使用前这些碱基变化可能增加更多，这都是可以预知的东西。
但也有人对疫苗的研究呈乐观态度。一位匿名者向媒体透露，所有的变异都已经在意料之中。尽管当前出现了越南、哈萨克斯坦、日本等多个地区异常病毒，但变异还没有引起抗原性和免疫原性的变化，那最后能影响到疫苗的有效性的概率就很低了。所以最后微量变异对策就是，把疫苗研发成为多价的就可以了。
更值得一提的是，当前受到第二次病毒爆发影响，日本国内又开始重新封闭。本来上个月的旅行恢复令让日本第二季度的经济刚见了一点点起色，没想到接着到来的是更汹涌的疫情。据日本政府声明，安倍首相的身体状况也已经出现了一些“不乐观情况”，厚生劳动省还称，对未来经济和疫情的担忧是目前国内民众最大的困扰。