研究首次对新冠病毒6大毒株进行跟踪分析:G株占主导,L型和V型正在逐渐消失

subtitle 前瞻网08-05 11:13 跟贴 2 条

科学家们目前已经从新冠病毒中分离出至少6个不同的毒株。他们表示,尽管病毒发生了变异,但几乎没有变化,这对正在研制可行疫苗的研究人员来说是个好消息。

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这些是对新冠病毒测序进行的最广泛的研究的结果。博洛尼亚大学(the University of Bologna)的研究人员对48,635个病毒基因组进行了分析,这些基因组是由世界各地实验室的研究人员分离出来的。这项研究发表在《微生物学前沿》(Frontiers in Microbiology)杂志上,题为“Geographic and Genomic Distribution of SARS-CoV-2 Mutations”。

在这些基础上,研究人员就有可能绘制出病毒传播到各大洲期间发生的传播和变异。初步结果令人鼓舞:新冠病毒几乎没有变化,每个样本大约有7个突变。普通流感的变异性率则达到了新冠病毒变异率的两倍多。

“新冠病毒可能已经优化到可以影响人类,这就解释了它的低进化变化,”尤尼博研究员、这项研究的协调员费德里科·乔吉(Federico Giorgi)解释说:“这意味着我们正在开发的治疗方法——包括疫苗,可能对所有的病毒毒株都有效。”

目前,新冠病毒共有六种毒株。最早的是L型菌株,于2019年12月在武汉出现。它的第一个突变株S株出现在2020年初。而从2020年1月中旬开始,我们已经有了V株和G株。到目前为止,G株是最广泛的:它在2020年2月底突变为GR株和GH株。

“到目前为止,G株及其相关的GR和GH株传播最广,占我们分析的所有基因序列的74%,”Giorgi说。“他们出现了四种突变,其中两种能够改变病毒的RNA聚合酶和刺突蛋白的序列。这一特征可能促进了病毒的传播。”

如果我们看看冠状病毒分布图,就会发现菌株G和GR在欧洲和意大利最常见。根据现有的数据,生长突变在意大利几乎不存在,而在法国和德国出现的频率更高。这似乎证实了上个月采取的控制措施的有效性。

在北美,最广泛的毒株是GH;而在南美洲,GR毒株更常见。在武汉L菌株最初出现的亚洲地区,G、GH和GR的传播呈上升趋势。这些病毒在欧洲传播一个多月后,于3月初才登陆亚洲。

从全球范围来看,菌株G、GH和GR不断增加。在美国和西班牙的一些限制地区可以发现S菌株。而L型和V型菌株正在逐渐消失。

除了这6种主要的新冠病毒毒株之外,研究人员还发现了一些不常见的突变,这些突变目前并不令人担忧,但仍应加以监测。

具体而言,在测序完整病毒基因组数量最高的前40个国家中(图1C),与世界平均水平相比,以下国家的每个样本中观察到的突变数量略有但明显更高:印度(8.40),刚果(8.30),孟加拉国(9.83)和哈萨克斯坦(9.47)。另一方面,来自以下国家或地区的序列显示出较低的突变负担:德国(6.09),日本(4.55),意大利(5.92),希腊(5.91),中国香港(5.00)和肯尼亚(5.38)。必须注意的一点是,一些抽样偏差可能会影响这一比较:例如,一些国家在大流行的早期阶段产生了最高数量的序列(如意大利),因此可能只观察到了较少的突变。

图1:(A)所有SARS-CoV-2基因组样本的突变事件数量分布。(B)每个样本的突变数分布,按大陆划分。(C)标志了在全国范围内进行分层,使用40个测序基因组最多的国家。

“罕见的基因组突变不到全部测序基因组的1%,”Giorgi证实。“然而,我们对它们进行研究和分析是最基本的,这样我们就可以确定它们的功能并监测它们的传播。所有国家都应该通过提供有关病毒基因组序列的数据,为这一领域做出贡献。”

编译/前瞻经济学人APP资讯组

参考来源:https://scitechdaily.com/the-six-strains-of-sars-cov-2-despite-its-mutations-the-virus-shows-little-variability/

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2020.01800/full

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