这是个颇为难讲清楚的话题，也是争论不休的一个中医基本问题，但是如果我们中医自己都讲不清楚自己的基本理论，如何去治病？我们自己都不信服，如何让别人信服？然而纯理论又是枯燥的，关于这个理论也是让很多人头痛，这里我就发表一点自己的陋见，不到之处，还请各位高抬贵手。
古代道教人士一般把丹田之火称之为君火，把命门之火叫做相火。然而在古代中医却认为心火是君火，同时也认为命门火是相火，自古以来道家和医家各执己见，那么到底哪个才是正确的呢？
我们知道人的一生可以划分为先天和后天，未出生以前叫做先天，出生以后叫做后天，君火和相火其实也分先后天。在没有离开母体之前，我们用的是脐带进行呼吸，一身之气都依赖这个，所以不管是君火还是相火，都是在下的，这是很好理解的；然而当我们离开母体后，不再用期待呼吸，而是用肺呼吸，一身之气在上，所以后天的君火和相火都是在上的。
因为在母体之时，最开始还没有胚胎时即是我们最常说的天一生水，然后形成胚胎，逐渐开始用脐带呼吸，这个过程的发生就是有动气在内，这个源源不断的动气也就是所谓的气海，道家称之为丹田；然后在这里形成地二生火，这个最起初的火，就是元火，又被称之为元阳（元阳即是最开始的阳气）；然后又一点元阳逐渐充足，好比星星之火可以燎原一样，待元阳充足之后，则会充养形成任督二脉，所谓的命门准确的含义是督脉进入脊柱的关隘，所以命门里面所产生的火和丹田内的元阳之火是一气相通的，这就是道家为什么把丹田称之为君火，命门称之为相火的缘由，君火在前，火力旺，相火在后，火力辅佐君火，二者一气同源。
出生以后，叫做后天，后天的君火是心火，相火是胆中所寄之火，在内经中讲到五运六气时，只有少阳相火，从没没用讲过命门相火，大家可以查一查内经看看是不是如此。后天出生后呼吸自然之气，所以人体气化自然当与天地五行相参，从五行来说，肝胆为春木，心肠为夏火，肝为甲木，胆为乙木。甲木生丙火，乙木生丁火，甲丙为阳，乙丁为阴，故甲木所生之火为大火，为君火，乙木所生之火为小火，为相火，故君火温暖一身，犹如日丽中天，照耀五脏六腑，而相火为辅佐，如同家中煮饭之火，两者缺一不可，相互辅佐。
上述就是我的意见陋见，肯定有不正确的地方，希望高人能够指点一二也是在下所幸！