肺癌是全球癌症发病率和死亡率最高的疾病。5年生存率不到20％。肺腺癌（LUAD）是非小细胞肺癌（NSCLC）最常见的组织学亚型，约占肺癌的40％。LUAD最常见的危险因素是吸烟。肺腺癌（LUAD）的基因组研究提高了我们对该疾病生物学和加速靶向治疗的理解。但是，LUAD的蛋白质组学特性仍然知之甚少。
2020年7月9日，中国科学院上海药物研究所谭敏佳、国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院肖汀、军事科学院军事医学研究院、国家蛋白质科学中心（北京）贺福初、上海交通大学李婧以及军事医学研究院、国家蛋白质科学中心（北京）汪宜共同通讯在Cell 在线发表题为“Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma”的研究论文，该研究对103例中国患者的LUAD进行了全面的蛋白质组学分析。蛋白质组学，磷酸化蛋白质组学，转录组和全外显子组测序数据的综合分析显示了癌症相关的特征，例如肿瘤相关的蛋白质变体，独特的蛋白质组学特征以及早期患者或具有EGFR和TP53突变的患者的临床结局。
基于蛋白质组的LUAD分层显示了与不同的临床和分子特征相关的三种亚型（S-I，S-II和S-III）。此外，该研究提名了潜在的药物靶标并验证了HSP90β的血浆蛋白水平是独立队列中LUAD的潜在预后生物标志物。该研究的综合蛋白质组学分析可以更全面地了解LUAD的分子结构，并为更精确的诊断和治疗提供机会。
肺癌是全球癌症发病率和死亡率最高的疾病。5年生存率不到20％。肺腺癌（LUAD）是非小细胞肺癌（NSCLC）最常见的组织学亚型，约占肺癌的40％。LUAD最常见的危险因素是吸烟。其他风险因素包括职业接触致癌物和室外空气污染。近年来，非吸烟患者的诊断急剧增加，突显了非吸烟危险因素在LUAD发展中的重要性。
在过去的十年中，西方国家进行的大规模基因组研究揭示了LUAD的驱动基因。其中最常见的体细胞突变是TP53，KRAS，KEAP1，STK11和EGFR。在中国和其他亚洲国家，EGFR突变的女性从不吸烟者占LUAD病例的很大比例（40％–50％）。LUAD的治疗选择包括手术，放疗，化学疗法，靶向治疗和免疫治疗或这些治疗的组合。
针对几种致癌驱动物的靶向疗法和针对免疫检查点的免疫疗法的最新进展取得了显著成功。EGFR和BRAF V600E突变，ALK和ROS1重排的抑制剂以及针对PD-1或PD-L1的免疫检查点抑制剂抗体已获批准用于LUAD的精准治疗 。针对MET扩增，RET重排和ERBB2（HER2）突变的其他新兴疗法也显示出了令人鼓舞的潜在益处。
尽管取得了这一进展，但由于关键致癌信号通路中缺乏已知的基因突变，或者由于难以靶向致癌突变（例如，KRAS突变），LUAD仍占很大比例，而没有可用的靶向治疗选择。此外，通常在肺癌患者中观察到对靶向疗法的内在和获得性耐药。由于蛋白质是细胞的功能执行者，因此LUAD蛋白质组和信号转导（磷酸化蛋白质组）的深入表征将为全面了解该疾病的分子机制和开发新的治疗方法奠定基础。
在这项研究中，使用从103个LUAD肿瘤及其配对的非癌性相邻组织（NAT）中收集的蛋白质组学，磷酸化蛋白质组学和基因组学数据进行了完整的组学分析。该研究数据提供了探索遗传变异与转录或翻译调控之间关系的资源。蛋白质组学数据的进一步分析揭示了不同基因型亚组中与LUAD相关的分子特征及其相关的临床结果。
参考消息：
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30676-0